摘要：
参考： R语言核心技能：交互式展示Shiny 中文 R语言用Shiny包快速搭建交互网页应用 R七种武器之交互化展示包shiny 用R的shiny包写一个基因的ID转换小程序 https://github.com/jmzeng1314/my-R 使用SQLite SQLite - Python python开发_sqlite3_绝对完整_博主推荐 阅读全文
摘要：
参考： GFF格式说明 Generic Feature Format Version 3 (GFF3) 先下载一个 gtf 文件浏览一下 1 havana gene 11869 14409 . + . gene_id "ENSG00000223972"; gene_version "5"; gene_name "DDX1... 阅读全文
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参考： R的bioconductor包TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene详解 Bioconductor的数据包library(org.Hs.eg.db)简介 阅读全文
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数据库 ANNOVAR: functional annotation of genetic variants from high-throughput sequencing data. 基因组变异数据的功能注释，人重必用 KEGG：a database resource for understand 阅读全文
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过滤 SOAPnuke：华大自主开发的一款针对fastq文件的过滤软件。 HTSeq-count：一款用于reads计数的轻便软件，作者介绍说可以用于多种mapping软件的输出结果，而我则用于tophat2的输出文件做计数。不过貌似所有能转换为sam格式文件的输出都可以用htseq-count计数 阅读全文
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nobel prize - 地位无需多说，地球人都知道。 机器之心：国内不错的机器学习团体，有网站也有公众号，产出了很多精华内容。 生信技能树：俺是初期元老之一，网站论坛大部分是我搭建的，只是现在无暇管理了。 博耘生物：最早接触的一个搞生信培训的博士，也是华农的。 火光摇曳 - 夜幕降临之际，火光摇 阅读全文
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BioArt按：2017年1月23日，全球农业科技巨头企业先正达（Syngenta）公司在Nature杂志上报道了一个名为MATRILINEAL（MTL）的玉米花粉特异性磷脂酶基因，由于该基因能诱导玉米单倍体的产生且在其它作物中具有保守型，所以该基因的克隆有望在未来在更多的物种中进行单倍体育种，大大 阅读全文