摘要: kmer分析其实是非常耗费计算资源的,如果我们自己写脚本来分析kmer的话,首先要将所有的序列打断成一定长度的kmer,然后将所有的kmer存储起来,最后统计每个kmer出现的频率,或者统计出现指定次数的kmer一共有多少个。 为了节省资源,我们可以使用 Jellyfish 这个现成的软件来分析。 JELLYFISH - Fast, Parallel k-mer Counting for DN... 阅读全文
posted @ 2017-01-10 17:20 Life·Intelligence 阅读(854) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 外泌体现在很火,搞医学的都应该好好了解它。 外泌体简介 1983年,外泌体首次于绵羊网织红细胞中被发现, 1987年Johnstone将其命名为“exosome”。现今,其特指直径在40-100nm的盘状囊泡。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体。其主要来源于细胞内内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中 。 外泌体介导的细胞间通讯 人体内多种细胞及... 阅读全文
posted @ 2017-01-10 14:33 Life·Intelligence 阅读(1847) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: ORF和CDS的区别 ORF的英文展开是open reading frame(开放阅读框)。 CDS的英文展开是coding sequences (编码区)。 CDS:DNA转录成mRNA,mRNA经剪接等加工后翻译出蛋白质,所谓CDS就是与蛋白质序列一 一对应的DNA序列,且该序列中间不含其它非该 阅读全文
posted @ 2017-01-10 11:43 Life·Intelligence 阅读(12003) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 参考: SSR标记 分子标记开发与筛选之SSR SSR 分子标记开发策略及评价 SSR分子标记在牡丹亲缘关系研究中的应用与研究进展 SSR(Simple Sequence Repeats)标记是近年来发展起来的一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术,也称为微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),是一类由几个核苷酸(一般为1~6个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联... 阅读全文
posted @ 2017-01-10 09:48 Life·Intelligence 阅读(1113) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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