摘要：
索引 1.统计fasta、fa和fastq文件的长度，统计fastq的reads个数，单个reads长度，reads总长度；统计fasta文件中contig的个数，列出名称，单条的长度，以及总长度。 2.1局部组装：创建目录，将比对好的reads按100k为单位，用samtools切，并用awk工具提起reads，分别存放在对应文件夹内 2.2局部组装：用得到的reads_name，去原始的下... 阅读全文
摘要：
学生信，Linux是最最基本的技能，要尽量将自己的工作平台转移到Linux，编程写脚本，这样会极大的提升工作效率，找工作时也不会太怂。Linux所有的任务都是通过命令来完成的，具有高度的统一性。Linux命令多，不可能都会，根据具体需求掌握部分即可。 awk文本处理利器，可以结合for进行批量处理。 阅读全文