摘要: 1. 前期准备 背景信息: GC含量 和 GC分布 基因组 重复程度 基因组大小估计 杂合情况 最好的情况是对方能提供已经发表的近源物种。根据近源物种分析以上信息,尤其是GC含量以及对应的GC分布,重复程度。 2. 测序策略 根据基因组大小和具体情况选择个大概的 k值 ,根据“测序X数推导说明.pd 阅读全文
posted @ 2016-06-12 15:05 Life·Intelligence 阅读(21496) 评论(0) 推荐(2) 编辑
摘要: 名词解释 De novo :拉丁文,从头开始的意思,de nove测序则是指在不需要任何参考序列的情况下对某一物种进行基因组测序,然后将测得的序列进行拼接、组装,从而绘制该物种的全基因组序列图谱。 重测序概念 :重测序是全基因组重新测序的简称,是指是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并 阅读全文
posted @ 2016-06-12 14:23 Life·Intelligence 阅读(24540) 评论(0) 推荐(2) 编辑
摘要: 原文链接: "Large Genome Assembly with PacBio Long Reads" 可以以多种方式利用PacBio长reads来生成和改进大型基因组的de novo组装。 你可以用几种不同的方法: 1. PacBio only de novo 组装 。long insert l 阅读全文
posted @ 2016-06-12 13:17 Life·Intelligence 阅读(5828) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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