LncRNA
简介:长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)通过多种机制发挥其生物学功能, 这些机制包括基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等。lncRNA通过这些作用机制在不同水平进行基因表达调控。
长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA[1]。研究表明, lncRNA在剂量补偿效应(Dosage compensation effect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用
根据lncRNA与蛋白质编码基因的位置关系, 可将它们分为重叠型、顺式反义型、双向型和内含子型等;而根据lncRNA的功能, 则可将其分为信号分子(Signal molecule)、诱饵分子(Decoy molecule)、引导分子(Guide molecule)和骨架分子(Scaffold molecule)等4类分子。
其中,lncRNAdb 是专门针对lncRNA的数据库。
网址:http://www.lncrnadb.org/
它收录了今年来文献报道的相关物种的lncRNA信息,包括lncRNA的名称,别名,特征,功能,参考文献等等。
其他的相关网站:
agilent_ncRNA
https://earray.chem.agilent.com/earray/
lncRNAdb
http://lncrnadb.com/
Gencode
http://www.gencodegenes.org/
H-invDB
http://h-invitational.jp/hinv/
NONCODE
http://noncode.org/NONCODERv3/guide.htm
RefSeq
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/RefSeq/
Ultra-conserved
http://users.soe.ucsc.edu/~jill/ultra.html
UCSC_lincRNAsTranscripts
http://genome.ucsc.edu
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