文章列表

项目实战

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项目一：使用二代测序数据进行基因组组装（局部组装）

项目二：使用机器学习（SVM）进行基因预测

• libsvm-3.21使用文档
• Libsvm：脚本（easy.py、grid.py、subset.py、checkdata.py） | MATLAB/OCTAVE interface | Python interface
• Weka 3: Data Mining Software in Java

 

Perl

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Perl 语法 - 基础

Perl 语法 - 高级特性

 

机器学习

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机器学习概览

Machine Learning - 第1周（Introduction、Linear Regression with One Variable、Linear Algebra Review）

Machine Learning - 第2周（Linear Regression with Multiple Variables、Octave/Matlab Tutorial）

• Octave入门

Machine Learning - 第3周（Logistic Regression、Regularization）

Machine Learning - 第4周（Neural Networks: Representation）

Machine Learning - 第5周（Neural Networks: Learning）

Machine Learning - 第6周（Advice for Applying Machine Learning、Machine Learning System Design）

Machine Learning - 第7周（Support Vector Machines）

 

生物信息

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基因组组装工具之 SOAPdenovo 使用方法

可视化工具之 IGV 使用方法

SAM格式 及 比对工具之 samtools 使用方法

比对工具之 BWA 使用方法

 

学习资源

必读文献