Signac处理bulk ATAC-seq数据

Diffbind可以处理bulk ATAC-seq数据,但一些motif的高级分析就要单独做。

 

恰好,Signac R包,为单细胞而设计,包含了很多内置的motif分析,比如motif综合活性,可以很方便的做一些下游分析,比如correlation。

 

代码:http://localhost:17449/lab/tree/projects/BAF_SOX9/diffbind/3.ATAC-Histone.ipynb

posted @ 2024-11-08 00:48  Life·Intelligence  阅读(17)  评论(0编辑  收藏  举报
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