Signac处理bulk ATAC-seq数据
Diffbind可以处理bulk ATAC-seq数据,但一些motif的高级分析就要单独做。
恰好,Signac R包,为单细胞而设计,包含了很多内置的motif分析,比如motif综合活性,可以很方便的做一些下游分析,比如correlation。
代码:http://localhost:17449/lab/tree/projects/BAF_SOX9/diffbind/3.ATAC-Histone.ipynb
Diffbind可以处理bulk ATAC-seq数据,但一些motif的高级分析就要单独做。
恰好,Signac R包,为单细胞而设计,包含了很多内置的motif分析,比如motif综合活性,可以很方便的做一些下游分析,比如correlation。
代码:http://localhost:17449/lab/tree/projects/BAF_SOX9/diffbind/3.ATAC-Histone.ipynb