多领域综述 | 框架思维 | 套路思维
BioArt/解螺旋 这一类的公众号真的非常好,给读者整理了各种综述。
个人可以根据自己的需求Rank一下,重点阅读。
框架思维
为了圣杯,持之以恒。
看综述真滴爽,一直看一直爽。
bioart上我感兴趣的综述:
- Pol I,合成大核糖体RNA(rRNA)的前体
- Pol II,合成信使RNA(mRNA)和大量非编码RNA
- Pol III,合成转运RNA(tRNA)和小核糖体RNA
- 绝大多数生物的起始密码子 (initiation codon)都是AUG,在DNA上则是ATG。
- 细胞内的各种组分如何在正确的时间以及空间上聚集以执行其相应的功能
- 无膜包裹的细胞器是如何形成,以及其物理化学本质
『珍藏版』Nature 综述 | 细胞命运决定中的转录因子与基因组三维构象
- 以基因转录为核心的细胞状态决定机制应该同时包括转录因子、表观遗传修饰和基因组三维构象等多层次的调节因素
『珍藏版』 Nature综述 | 表观遗传研究将遗传与环境和疾病相连接
『珍藏版』Nat Rev Genetics | 染色质结合RNA助力功能基因组相互作用
- RNA与染色质的结合机制
- 鉴定染色体结合RNA的策略
- 新生RNA的调控功能
- 重复区域来源的RNA介导基因沉默
- RNA与核体形成
- 功能基因组中的RNA
致敬大师Donald D. Brown——转录调控领域的拓荒者
- 病毒入侵机制的研究;氨基酸代谢;第一次揭示了核仁的功能——生产核糖体RNA;该工作把基因通过质粒导入细菌中,开启了使用DNA重组技术来研究真核基因的时代。
- 为什么说他是转录调控的大师?新时代到来以后,Donald迅速采用重组DNA的方法重新分析了5S rRNA。他在5S rRNA基因的中间位置发现了一个区域,该区域可以控制RNA的生成。第一个被鉴定的真核基因转录因子。
- 激素在青蛙和蟾蜍变态发育过程中的作用
- 生命科学将在药物研发过程中扮演着重要的角色
- Donald对学术界做出的实质性贡献不仅仅归功于他做的许多基础性的研究,还在于他无私地培养了一代如今是学术界中流砥柱的科学家。
- Two important themes have influenced my 50 years in science. The first is independence. My second theme is the importance of young scientists in research.
致敬Robert Roeder & 纪念真核生物RNA聚合酶发现50周年——转录调控研究简史
- 初出茅庐发现三种RNA聚合酶
- 建立体外无细胞转录系统
- 多种转录因子的发现
- 关键的转录辅因子——中介体复合物(Mediatorcomplex)
『珍藏版』真核转录50周年纪念之一:RNA聚合酶II转录过程中的DNA模板的转变过程
『珍藏版』真核转录50周年纪念之二:RNA聚合酶Ⅱ延伸因子的发现史
『珍藏版』综述丨伊成器、宋春啸等全面总结DNA和RNA修饰的检测方法和研究困境
- 详细总结了目前高通量DNA/RNA修饰检测技术的方法和发现,包括应用三代测序在单碱基水平鉴定修饰位点,并讨论了该领域存在的问题和今后研究的方向。
Nature | Wnt和TGFβ信号协同调控与个体大小相关的生物行为
- Wnt和TGFβ信号通路的模式化分布协调了个体大小与机械感受神经元的模式化分布,进而调控分裂起始频率,最终调节涡虫的横裂生殖。
『珍藏版』综述 | 众人拾柴:NIH表观遗传组学蓝图计划的成功
- Roadmap
- 表观遗传组学是研究DNA和组蛋白修饰的科学。
- 聚焦于人类组织和细胞,而不是动物细胞和动物模型
- 在全基因组水平而不是单个基因位点或者多个基因位点,研究表观遗传特点
- 重点在于发现新的表观修饰标志物
『珍藏版』Science“基因型到表型”特刊之一 | 深度解析人类基因型-表型相关性研究
- 遗传分析(genetic analysis)亦称基因分析,是测定有关某一遗传性状的基因数目、基因性质、属于哪一连锁群及其在染色体上的座位等的过程。
- 直接影响和间接影响
- 混淆影响(Confounding effects)
- 家族基因型数据的利用
- 遗传可能性
- 连锁不平衡评分回归(LDSC)
- 孟德尔随机化(MR)
- 基因-环境(GxE)相互作用
『珍藏版』Science“基因型到表型”特刊之二 | 单细胞基因组学助力人类细胞表型的研究
『珍藏版』Mol Cell | 癌症中的单细胞RNA测序:经验与挑战
- 细胞类型、细胞状态、恶性肿瘤和非恶性肿瘤细胞
- 系统回顾了人类疾病遗传学发展的里程碑事件,详细枚举了遗传变异与功能表型关系的全基因组分析方法和未来十年发展的策略和方向,并总结反思人类疾病遗传学领域研究获得的经验教训。
干细胞类器官相关综述
『珍藏版』Nat Cell Bio综述 | 干细胞疗法研究进展
Science类器官特刊(一)丨类器官新技术——类器官和器官芯片的完美结合
Science类器官特刊(二) | 胚胎干细胞自组装:哺乳动物的早期胚胎发育
基因编辑相关综述
『珍藏版』Nature综述 | 基因编辑技术在临床应用方面的机遇与挑战
GWAS相关综述
RNA相关综述
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『珍藏版』Nature综述 | 利用固有免疫进行免疫治疗
套路思维
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本实验室套路在此,热点的组蛋白修饰基因。
- 组蛋白甲基化/组蛋白甲基转移酶(EZH2)
- 组蛋白乙酰化与脱乙酰化 组蛋白脱乙酰化酶 HDAC1
待续~