Phenome-wide association studies | PheWAS

TOC

什么是Phenome-wide association studies?产生背景

PheWAS的基本原理,应用场景

PheWAS与GWAS的区别和联系

PheWAS实例


 

什么是Phenome-wide association studies?产生背景

More recently, phenome-wide association studies (PheWAS) have been used to interrogate with which phenotypes a given genetic variant may be associated (Denny et al., 2010).

 

PheWAS的基本原理,应用场景

Phenome-wide association studies (PheWAS) have been used to replicate known genetic associations and discover new phenotype associations for genetic variants.

 

PheWAS与GWAS的区别和联系

GWAS是给定phenotype,检验所有的variants。

PheWAS是给定variant,检验所有的phenotypes。

 

PheWAS实例

PheWAS plot for a SNP or gene can be created across GWAS in the database.

https://atlas.ctglab.nl/PheWAS

随便搜索一个基因或SNP:Sox10、rs13238909

会得到我们的基因或SNP与哪个trait最相关,需要非常大的数据库才能做这个分析。

 

学会了GWAS,理解PheWAS就毫无压力了。

 

 

参考:

R PheWAS: data analysis and plotting tools for phenome-wide association studies in the R environment

 

posted @   Life·Intelligence  阅读(2186)  评论(0编辑  收藏  举报
(评论功能已被禁用)
编辑推荐:
· 基于Microsoft.Extensions.AI核心库实现RAG应用
· Linux系列:如何用heaptrack跟踪.NET程序的非托管内存泄露
· 开发者必知的日志记录最佳实践
· SQL Server 2025 AI相关能力初探
· Linux系列:如何用 C#调用 C方法造成内存泄露
阅读排行:
· 震惊!C++程序真的从main开始吗?99%的程序员都答错了
· 【硬核科普】Trae如何「偷看」你的代码?零基础破解AI编程运行原理
· 单元测试从入门到精通
· 上周热点回顾(3.3-3.9)
· winform 绘制太阳,地球,月球 运作规律
历史上的今天:
2016-07-22 与MySQL的零距离接触 - 慕课网
2016-07-22 Python开发简单爬虫 - 慕课网
TOP
点击右上角即可分享
微信分享提示