UK Biobank专题 | UKBB

 

如何申请UKBB数据？

• UK Biobank数据申请的基本流程?
• UKBB数据下载流程（第一节）
• UKBB数据集下载流程（第二节）

 

2022 - NG - Combined effects of host genetics and diet on human gut microbiota and incident disease in a single population cohort

 

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这个时代的生信，统计遗传，不懂或不会用这个数据库就说不过去了。

看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的：

For the near future, the UK Biobank is pushing the barriers further by releasing both genome-wide genotypes and rich phenotypic data on 500,000 people to the international research community.

 

Nature 4连发 - 这四篇基本把能做的分析都做了

我们应该重点关注的是这个数据挖掘的部分 - health genetics，挖掘得最好的都发在NG上了。

The UK Biobank resource with deep phenotyping and genomic data  - 介绍UK biobank数据库的特性

Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank - 之前有篇抑郁症depression的NG paper

 

UKbiobank数据是好，但是基本的分析别人早就做过了，你想再做只能往深处继续挖掘了，否则想发NG是不可能的。

做UKbiobank最大的好处就是考验你的数据挖掘能力，因为一般中小课题组根本拿不到这么大的项目，所以90%搞统计遗传的一辈子都拿不到这样规模的数据，现在UKbiobank免费给你数据，你还不偷着乐啊。

 

我现在有机会拿到现成的UKbiobank数据，但是能力不足，所以必须先看看别人是怎么做得！

 

现在最火的当之无愧就是neuron imaging的data

 

2018 - Association analysis in over 329,000 individuals identifies 116 independent variants influencing neuroticism - 没做什么深入的分析，无非就是找到位点，做了个pathway enrichment而已。

2018 - Genome-wide analyses using UK Biobank data provide insights into the genetic architecture of osteoarthritis

2018 - Genome-wide association meta-analysis of individuals of European ancestry identifies new loci explaining a substantial fraction of hair color variation and heritability

2018 - Signatures of negative selection in the genetic architecture of human complex traits 这才是我期待的最完美的数据挖掘，自成一套的算法，再挖UKBB的数据。