miRNA 综述文章
最近由于看基因组文章看的有点兴奋，于是返了个场，学习下micRNA。
下载了一篇自己捯饬的paper，啃了很久还是不是很明白，然后我突然看了一个单词，vivo，原来只以为vivo就是手机只能照亮你的美，到现在才发现vivo还能证明我的英语还真的很烂。
vivo：活泼的样子
In vivo ：是活体,体内实验
在学术文章中 in vivo 指的是活体中，不是某高赞助的广告~~~
但是小编这里也暗暗自喜，想起了这个标题，micRNA对基因表达的调控，使得机体得以正常发挥作用，那岂止是照亮你的美~~。
一、摘要
总所周知，小ncRNA 可以对基因的表达产生一定的调控作用，并进一步的影响生物学功能。最近测序技术的发展和信息分析手段（生信人）的提升使得对ncRNA进行分类成为可能。从他们的前体结构和合成途径以及作用方式上（precursor structures, biogenesis pathways and modes of action）可以分为
（1）small interfering RNAs（siRNA）：小干扰RNA， 是一个长20到25个核苷酸的双股RNA，在生物学上有许多不同的用途。目前已知siRNA主要参与RNA干扰（RNAi）现象，以带有专一性的方式调节基因的表达。
（2）microRNAs(miRNAs)：是一种小的，类似于siRNA的分子，由高等真核生物基因组编码，miRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体（RISC）降解mRNA或阻碍其翻译。
（3）PIWI-interacting RNAs (piRNAs)：只在哺乳动物的睾丸中存在，并且只和PiWi蛋白结合形成piRNA复合物，和RNA沉默有关，作用于生殖细胞，调控转座子表达。
（4）endogenous small interfering RNAs (endo-siRNAs or
esiRNAs)：内源性的小分子干扰RNA
（5）promoter associate RNAs (pRNAs)
（6） small nucleolar RNAs (snoRNAs) :核仁小分子RNA
（7）sno-derived RNAs
二、miRNA合成途径
miRNA 广泛的存在植物和动物组织内，公认在转录组水平上大约60%的基因被调控修饰过。其作用相当广泛和重要，和众多的生理学过程相关，比如分化、增殖、凋亡与发育。如果调控失败，会导致各种疾病，比如肌肉萎缩、糖尿病和各种癌症。
miRNA的合成较为复杂，文章中描述较为枯燥，这里以动物中miRNA合成图示为例.
三、细胞质miRNA的作用
miRNA对于靶基因的调控，如上图，在植物和动物中不太一样。在植物中通过（动物中较少）通过和靶基因的完美匹配来识别靶基因，并导致基因cleavage或者disruption。而在动物中，往往只有seed区域对于靶基因的识别有重要的作用，这一部分种子序列正好识别的是靶基因的3UTR区域。
然后，in vivo（体内实验）中有些miRNA和靶基因互作也不是完全按照严格的配对原则（配对比例在~15%-80%）。
四、发挥作用的机制
For a long time, the predominant idea was that variation in the composition of RISCs led to alternative mechanisms for post-transcriptional control.
More recently, the outlook has changed. The current model proposes that, in a sequential process, the RISC switches off its targets by repressing mRNA translation at first and subsequently initiating degradation [27]. However, it has been suggested that the sequential order of these two events reflects kinetic differences between translational repression and mRNA decay rather than a cause-and-effect relationship between them。
很久以来，大家认为miRNA和靶基因结合之后就会导致mRNA直接降解，但是现在大家普遍认为在导致mRNA降解之前，还有对mRNA的抑制作用。
五、核内功能
核内小RNA的功能整理如下
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调控RNA转录
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调控mRNA
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调控可变剪切
-
miRNA在转录中的作用
1、转录基因沉默
2、转录基因激活
六、结论
总而言之，无论是细胞核外，还是细胞核内的miRNA都是通过不同的机制来对基因表达进行调控的。其整体的调控示意图如下
参考文献:MicroRNA in Control of Gene Expression: An Overview of Nuclear Functions
