[NLP] 2.3 编辑距离和对齐 (Edit Distance and Alignment)

获得两个strings的距离,是非常有价值的事情。
你可以用这个进行单词的修正,例如你在office里面输入了单词graffe,然后软件帮你自动搜索最近的单词,类似graf,graft等等。
对于基因编辑来说,也非常有帮助。我们都知道基因由AGCT序列组合而成,它们可以被视为文本,然后查找最近的基因序列。

Edit Distance 编辑距离

我们可以使用编辑距离,表征两个strings的关系,其中『编辑』包含了如下操作:

  • 插入
  • 删除
  • 替换
    使用这三个操作,能够把一个字符变成另外一个,最少使用多少次,那么就是编辑距离。

如何获取最小编辑距离,其实就是一道leetcode困难题的事儿:

class Solution:
    def minDistance(self, word1: str, word2: str) -> int:
        # x轴是word2,y是word1,+1是初始位置
        dp = [[0]* (len(word2)+1) for _ in range(len(word1)+1)]
        # 初始空位置,如果想要成为word1,需要不停的insert操作
        for i in range(len(dp)):
            dp[i][0] = i
        # 同理,如果想要成为word2,也要不停的insert
        for j in range(len(dp[0])):
            dp[0][j] = j
        # 从(1,1)开始迭代
        for i in range(1,len(dp)):
            for j in range(1,len(dp[i])):
                # 取左,上,左上的最小值,然后进行一个操作(+1)
                dp[i][j] = min(dp[i-1][j],dp[i][j-1],dp[i-1][j-1]) + 1
                # 如果两个字符相同,那不用变,直接取左上的操作数
                if word1[i-1] == word2[j-1]:
                    dp[i][j] =dp[i-1][j-1]
        return dp[-1][-1]

直接看题解即可:
https://leetcode-cn.com/problems/edit-distance/solution/edit-distance-by-ikaruga/

posted @ 2020-12-15 18:37  schaffen  阅读(361)  评论(0编辑  收藏  举报