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2022年1月18日

身体健康和精神健康相互作用,其中之一受到打击时,另一个也会受到影响

摘要: 身体健康和精神健康相互作用,其中之一受到打击时,另一个也会受到影响 阅读全文

posted @ 2022-01-18 22:41 BioinformaticsMaster 阅读(31) 评论(0) 推荐(0) 编辑

科研路上,能往前走,就往前走,不犯完美主义错误, 警惕常见读博误区

摘要: 科研路上,能往前走,就往前走,可以先这么着,把这槛迈过去再说,后面再学习 不犯完美主义错误, 不拖延。 科研路,partner是非常重要的,遵循共为,共享。 警惕博士失败的常见情形 犹他大学计算机科学教授Matt Might写了一篇题为“10种容易让博士生失败的原因”的文章,他声称这个列表与任何学科 阅读全文

posted @ 2022-01-18 22:02 BioinformaticsMaster 阅读(132) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年1月15日

excel 快速选中连续行

摘要: excel 快速选中第二行到最后一行 选中 第二行所需列 按 command(control) shift 下箭头 需要的话,复制或粘贴都可以了。 选中倒数多少行 选中最后一行 command shift 上箭头 选中指定行范围 选中左上 / 左下/ 右上/ 右下 其中之一的起始单元格 按住shif 阅读全文

posted @ 2022-01-15 14:12 BioinformaticsMaster 阅读(491) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年1月13日

给指定用户开通读写权限

摘要: setfacl -m u:st_mchri_bigdata:rxw -R /jdfssz1/ST_HEALTH/P21Z10200N0047/lizhichao/data_transfer setfacl -m u:st_rm:rx -R /zfssz3/ST_MCHRI/BIGDATA/autoa 阅读全文

posted @ 2022-01-13 10:13 BioinformaticsMaster 阅读(96) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年1月12日

tar 压缩文件list所有文件

摘要: 行尾$替换为 \ 注:空格\ 第一行行首加tar czvf 压缩后文件前缀.tar.gz 最后一行行尾可以加 && echo "done" 结果如下: tar czvf test.tar.gz COVIDHarbin.list.csv \COVIDHarbin.list.csv_copy \COVI 阅读全文

posted @ 2022-01-12 21:23 BioinformaticsMaster 阅读(240) 评论(0) 推荐(0) 编辑

sort 命令对文件多列详细排序

摘要: sort 命令 默认是打印出来,可以通过定向符> 或-o 指定输出文件 -t ' ' 指定分隔符为空格 -k 指定按分隔后的第几域排序 -n 按数值大小排序,默认是升序(从小到大) -r 表示逆序 reverse sort -t ' ' -k 1 sort_test.file # 对第一域默认按AS 阅读全文

posted @ 2022-01-12 21:10 BioinformaticsMaster 阅读(887) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux按行取文件

摘要: 文件前几行 head -n 5 $file 文件后几行 tail -n -5 $file 文件从第几行到结尾 tail -n +5 $file 区间行的文件 sed -n '2,5p' $file # 第二行到第5行 阅读全文

posted @ 2022-01-12 17:42 BioinformaticsMaster 阅读(53) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年1月6日

python 好用的分隔字符串,切片,pop

摘要: linelist=line.rstrip().split(",") # 去掉末尾空白符(空格 换行)后,按,分成列表 切片 linelist[i:j] 取linelist[i]到linelist[j-1] #[]内为索引 缺省i ,默认为0,即从起始元素开始,如linelist[:j] 缺省j, 默 阅读全文

posted @ 2022-01-06 14:33 BioinformaticsMaster 阅读(190) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年1月4日

python stderr.write() 和print()/stdout.write()不一个出口

摘要: print()默认情况下,和stdout.write()一个出口,区别是print()自带换行 stderr.write()另一个出口 1) 定义测试python脚本 import sys print ("print") sys.stdout.write("stdout") sys.stderr.w 阅读全文

posted @ 2022-01-04 16:46 BioinformaticsMaster 阅读(90) 评论(0) 推荐(0) 编辑

python 遍历大文件,处理数据时,时时把变量保存到文件,不增大变量,节省内存

摘要: # 多用write()def split_file(infile, n_parts, outdir): if not os.path.exists(infile): sys.stderr.write("Error: Can't find file: %s\n" % infile) sys.exit( 阅读全文

posted @ 2022-01-04 15:53 BioinformaticsMaster 阅读(143) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年1月1日

保存重要,未完的工作空间

摘要: save.image("hello.RData") 保存整个工作空间到文件,加载方式: 下次打开默认工作目录时如果有.RData文件时会自动加载 通过load() 读取工作空间 #save 是可以选择些变量保存到文件,如save(numbers_1, file = "hello1.RData") 保 阅读全文

posted @ 2022-01-01 15:27 BioinformaticsMaster 阅读(187) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R 随机取样 , 随机取文件的行

摘要: > sample(c(1:10),8) # 对向量取样,默认是不放回抽样,replace=FALSE > sample(c(1:10),8,replace=TRUE) # 放回抽样 对数据框不放回抽行 dataframe[sample(nrow(dataframe), 10), ] #datafra 阅读全文

posted @ 2022-01-01 15:01 BioinformaticsMaster 阅读(407) 评论(0) 推荐(0) 编辑

shell 判断目录是否存在

摘要: if [ ! -d "./shell" ];then mkdir ./shell fi # 注意[]内的各个空格 阅读全文

posted @ 2022-01-01 11:28 BioinformaticsMaster 阅读(87) 评论(0) 推荐(0) 编辑

mac bug

摘要: Error: Permission denied @ apply2files - /usr/local/lib/docker/cli-plugin 原因是最近删了docker,导致的错误。 Fix: 1.创建docker app目录 mkdir -p /Applications/Docker.app 阅读全文

posted @ 2022-01-01 09:59 BioinformaticsMaster 阅读(113) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2021年12月31日

awk场景命令

摘要: # 注 mac 要用gwak代替awk. ~/Documents/materials/linux_shell  awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} NR==FNR{a[$3]=$1;b[$3]=$2} NR>FNR{$2=a[$1];$3=b[$1]; {print $2,$3,$1} 阅读全文

posted @ 2021-12-31 19:57 BioinformaticsMaster 阅读(285) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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