身体健康和精神健康相互作用，其中之一受到打击时，另一个也会受到影响
摘要：
身体健康和精神健康相互作用，其中之一受到打击时，另一个也会受到影响 阅读全文
posted @ 2022-01-18 22:41 BioinformaticsMaster 阅读(31) 评论(0) 推荐(0) 编辑
科研路上，能往前走，就往前走，不犯完美主义错误， 警惕常见读博误区
摘要：
科研路上，能往前走，就往前走，可以先这么着，把这槛迈过去再说，后面再学习 不犯完美主义错误， 不拖延。 科研路，partner是非常重要的，遵循共为，共享。 警惕博士失败的常见情形 犹他大学计算机科学教授Matt Might写了一篇题为“10种容易让博士生失败的原因”的文章，他声称这个列表与任何学科 阅读全文
posted @ 2022-01-18 22:02 BioinformaticsMaster 阅读(134) 评论(0) 推荐(0) 编辑
excel 快速选中连续行
摘要：
excel 快速选中第二行到最后一行 选中 第二行所需列 按 command(control) shift 下箭头 需要的话，复制或粘贴都可以了。 选中倒数多少行 选中最后一行 command shift 上箭头 选中指定行范围 选中左上 / 左下/ 右上/ 右下 其中之一的起始单元格 按住shif 阅读全文
posted @ 2022-01-15 14:12 BioinformaticsMaster 阅读(493) 评论(0) 推荐(0) 编辑
给指定用户开通读写权限
摘要：
setfacl -m u:st_mchri_bigdata:rxw -R /jdfssz1/ST_HEALTH/P21Z10200N0047/lizhichao/data_transfer setfacl -m u:st_rm:rx -R /zfssz3/ST_MCHRI/BIGDATA/autoa 阅读全文
posted @ 2022-01-13 10:13 BioinformaticsMaster 阅读(96) 评论(0) 推荐(0) 编辑
tar 压缩文件list所有文件
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行尾$替换为 \ 注：空格\ 第一行行首加tar czvf 压缩后文件前缀.tar.gz 最后一行行尾可以加 && echo "done" 结果如下： tar czvf test.tar.gz COVIDHarbin.list.csv \COVIDHarbin.list.csv_copy \COVI 阅读全文
posted @ 2022-01-12 21:23 BioinformaticsMaster 阅读(240) 评论(0) 推荐(0) 编辑
sort 命令对文件多列详细排序
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sort 命令 默认是打印出来，可以通过定向符> 或-o 指定输出文件 -t ' ' 指定分隔符为空格 -k 指定按分隔后的第几域排序 -n 按数值大小排序，默认是升序（从小到大） -r 表示逆序 reverse sort -t ' ' -k 1 sort_test.file # 对第一域默认按AS 阅读全文
posted @ 2022-01-12 21:10 BioinformaticsMaster 阅读(903) 评论(0) 推荐(0) 编辑
linux按行取文件
摘要：
文件前几行 head -n 5 $file 文件后几行 tail -n -5 $file 文件从第几行到结尾 tail -n +5 $file 区间行的文件 sed -n '2,5p' $file # 第二行到第5行 阅读全文
posted @ 2022-01-12 17:42 BioinformaticsMaster 阅读(53) 评论(0) 推荐(0) 编辑
python 好用的分隔字符串，切片，pop
摘要：
linelist=line.rstrip().split(",") # 去掉末尾空白符（空格 换行）后，按,分成列表 切片 linelist[i:j] 取linelist[i]到linelist[j-1] #[]内为索引 缺省i ，默认为0，即从起始元素开始，如linelist[:j] 缺省j, 默 阅读全文
posted @ 2022-01-06 14:33 BioinformaticsMaster 阅读(191) 评论(0) 推荐(0) 编辑
python stderr.write() 和print()/stdout.write()不一个出口
摘要：
print()默认情况下，和stdout.write()一个出口，区别是print()自带换行 stderr.write()另一个出口 1) 定义测试python脚本 import sys print ("print") sys.stdout.write("stdout") sys.stderr.w 阅读全文
posted @ 2022-01-04 16:46 BioinformaticsMaster 阅读(90) 评论(0) 推荐(0) 编辑
python 遍历大文件，处理数据时，时时把变量保存到文件，不增大变量，节省内存
摘要：
# 多用write()def split_file(infile, n_parts, outdir): if not os.path.exists(infile): sys.stderr.write("Error: Can't find file: %s\n" % infile) sys.exit( 阅读全文
posted @ 2022-01-04 15:53 BioinformaticsMaster 阅读(143) 评论(0) 推荐(0) 编辑
保存重要，未完的工作空间
摘要：
save.image("hello.RData") 保存整个工作空间到文件，加载方式： 下次打开默认工作目录时如果有.RData文件时会自动加载 通过load() 读取工作空间 #save 是可以选择些变量保存到文件,如save(numbers_1, file = "hello1.RData") 保 阅读全文
posted @ 2022-01-01 15:27 BioinformaticsMaster 阅读(188) 评论(0) 推荐(0) 编辑
R 随机取样 ， 随机取文件的行
摘要：
> sample(c(1:10),8) # 对向量取样，默认是不放回抽样，replace=FALSE > sample(c(1:10),8,replace=TRUE) # 放回抽样 对数据框不放回抽行 dataframe[sample(nrow(dataframe), 10), ] #datafra 阅读全文
posted @ 2022-01-01 15:01 BioinformaticsMaster 阅读(413) 评论(0) 推荐(0) 编辑
shell 判断目录是否存在
摘要：
if [ ! -d "./shell" ];then mkdir ./shell fi # 注意[]内的各个空格 阅读全文
posted @ 2022-01-01 11:28 BioinformaticsMaster 阅读(87) 评论(0) 推荐(0) 编辑
