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2017年11月14日

vi全部替换

摘要: 全文替换比如将.o换为.c :%s/\.o/\.c/g %表示所有行,g表示全部替换 替换当前行第一个 :s/aaa/bbb/ 替换从1到12行所有 :1,12s/aaa/bbb/g 阅读全文

posted @ 2017-11-14 14:40 BioinformaticsMaster 阅读(449) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年11月7日

选择

摘要: 不知道选什么,先不选即是选择放弃both。 阅读全文

posted @ 2017-11-07 11:44 BioinformaticsMaster 阅读(102) 评论(0) 推荐(0) 编辑

知识 代码 算法

摘要: 生信知识 生信代码 生信算法 阅读全文

posted @ 2017-11-07 11:39 BioinformaticsMaster 阅读(149) 评论(0) 推荐(0) 编辑

code algorithm

摘要: code of algorithm 阅读全文

posted @ 2017-11-07 09:41 BioinformaticsMaster 阅读(124) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年10月26日

工作学习 手机不上手桌面

摘要: 有时间才会有希望,时间是希望的土壤,拒绝时间被信息碎片。工作学习期间,手机不上手,不上桌面。 阅读全文

posted @ 2017-10-26 11:13 BioinformaticsMaster 阅读(140) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年10月20日

Powershell -Window下比cmd.exe更具可读性、易用性、可面向对象的命令行客户端

摘要: win7以上版本自带Powershell 在搜索框中搜索”powershell“即可运行,感觉是向linux取经的windows命令行客户端。 常用命令: pwd mkdir cd ls rmdir cp mv more type(打印输出整个文件) dir -r (寻找文件) help exit 阅读全文

posted @ 2017-10-20 11:44 BioinformaticsMaster 阅读(230) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年10月19日

Cygwin - windows系统下运行linux操作 --代替linux虚拟机安装、双系统的繁琐

摘要: 我把Cygwin视为Windows用户熟练linxu系统操作的良好途径。它不需要虚拟机、双系统等安装对电脑知识、硬件的要求,只需要基本的软件安装操作即可。以下是安装步骤供小白同胞参考。 Cygwin安装: 1.下载安装 1.1 URL: https://cygwin.com/install.html 阅读全文

posted @ 2017-10-19 16:37 BioinformaticsMaster 阅读(463) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年9月29日

使用de Bruijn graph组装基因组的时候,Kmer数为何必须是奇数呢

摘要: 因为如果kmer是偶数,我们会发现基因组上有些序列(如,CGCGCGCG, kmer=4)的Kmer在反向互补后得到的序列仍然是它自身!而这是不能允许的,因为这将导致你无法区分某段序列的kmer到底是属于它自身还是说只是来自于它的互补链!!这将会给解组装的de Bruijn graph带来极大的困难 阅读全文

posted @ 2017-09-29 16:03 BioinformaticsMaster 阅读(1385) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年9月28日

Linux Shell t特殊变量 $0 $@ $# $_ $?

摘要: $0: 执行脚本的名字 $*和$@: 将所有参数返回 $#: 参数的个数 $_: 代表上一个命令的最后一个参数 $$: 代表所在命令的PID $!: 代表最后执行的后台命令的PID $?: 代表上一个命令执行是否成功的标志,如果执行成功则$? 为0,否则不为0 阅读全文

posted @ 2017-09-28 14:33 BioinformaticsMaster 阅读(536) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年9月26日

SOAPnuke 1.5.6

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posted @ 2017-09-26 15:52 BioinformaticsMaster 阅读(11) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年3月6日

perl open函数

摘要: open(DATA, "<file.txt"); # <只读打开file.txt ,DATA作为句柄 open(DATA, ">file.txt"); # 写入方式 open(DATA, "+<file.txt"); #打开文件不清空它更新 open DATA, "+>file.txt" or di 阅读全文

posted @ 2017-03-06 21:59 BioinformaticsMaster 阅读(355) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2017年2月25日

我的博客

摘要: 本博客发布生物信息的学习,以及Online pipeline的总结 。 技术点:linux shell perl python 二代测序 阅读全文

posted @ 2017-02-25 00:49 BioinformaticsMaster 阅读(168) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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