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t 分布表单侧与双侧的联系

摘要：目前很多的课程，由于t检验往往采用双侧检验，所以常默认是查双侧t分布表，即按0.05或0.01查询。而有些经典的课本如浙大版的《概率论与数理统计》则是单侧检验表，从双侧检验对应过来，应查0.025或0.005查询。在查表前，认真观察表头分布的概率示意图。如：单侧：阅读全文

posted @ 2019-11-11 19:05 BioinformaticsMaster 阅读(13740) 评论(0) 推荐(0) 编辑

哈迪温伯格平衡 & 检验

摘要：哈斯温伯格定律 Hardy–Weinberg equilibrium（Hardy–Weinberg principle ，HWP）及检验群体中代与代之间等位基因频率（allele frequency）基因型频率（genotype freqency）恒定 f(AA) = p2 f(aa) = q2 阅读全文

posted @ 2019-11-02 16:42 BioinformaticsMaster 阅读(6081) 评论(1) 推荐(0) 编辑

SNPs & MAF

摘要： SNPs，全称是single nucleotide polymorphisms，SNPs等位基因频率的容易估计。采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略。该策略的原理是：首先选择参考样本制作标准曲线，然后将待测的混和样本与标准曲线进行比较，根据所得信号的比例确定混和样本中各种等位基因的频率。阅读全文

posted @ 2019-11-02 16:09 BioinformaticsMaster 阅读(1477) 评论(0) 推荐(0) 编辑

convert 安装转换文件格式报错的解决方案

摘要： 1. convert安装： 2. 遇到的问题： 3.该问题解决办法：网上有这样的，亲测：不管用。pass contributed：对于没有运行Web服务器的桌面用户，只需消除这些限制就足够了。为此目的，可以删除文件，或重命名该文件。因此，所有政策都取消了，但如果需要，您仍可以恢复. 因为我的工具就阅读全文

posted @ 2019-07-04 15:21 BioinformaticsMaster 阅读(2524) 评论(0) 推荐(0) 编辑

literature read write 论文代码阅读与写作

摘要：我：文献是很好参考，Cell Nature Science 一般是高价值的参考，知道，思辨，用来自己这，解决问题，产出当感觉领域内重要基础知识模糊了，这时候就从知网下载、读一篇领域内的国内硕、博论文，因为他们往往由于毕业论文的字数压力，会在研究内容前把知识基础列的详详细细。比如《基于Meta分析阅读全文

posted @ 2019-06-25 21:04 BioinformaticsMaster 阅读(206) 评论(0) 推荐(0) 编辑

mac系统安装 python包

摘要： mac 虽然自带python，但是并没有自带pip等这样的管理包。 1.brew install pip 安装pip 时，报错： Error: No available formula with the name "pip" pip is part of the python formula: br 阅读全文

posted @ 2019-06-23 21:13 BioinformaticsMaster 阅读(766) 评论(0) 推荐(0) 编辑

JetBrains产品激活

摘要：本文适用于所有 JetBrains 系列产品亲测方法二队DataGrip可用。方法一、最新方法Jet Brains家族破解方法方法二、本方法来自网络原文地址 http://xidea.online 阅读全文

posted @ 2018-06-08 15:44 BioinformaticsMaster 阅读(152) 评论(0) 推荐(0) 编辑

VEP 注释工具 Ubuntu 安装

摘要：屡次尝试后的vep高效安装方式如下： Note VEP官网：https://asia.ensembl.org/info/genome/variation/index.html Note: 欢迎评论交流，转载请注明来源，谢谢。阅读全文

posted @ 2018-05-29 18:25 BioinformaticsMaster 阅读(1774) 评论(0) 推荐(0) 编辑

shell case 判断

摘要：注：1、*) 相当于其他语言中的default。 2、除了*)模式，各个分支中;;是必须的，;;相当于其他语言中的break 3、 | 分割多个模式，相当于or 参考：https://blog.csdn.net/love__coder/article/details/7262160 阅读全文

posted @ 2018-05-28 21:14 BioinformaticsMaster 阅读(167) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Python装饰器 name binding

摘要： python 装饰器函数或方法 @decorate def fun(a,b): ... fun(1,2) 时即 fun=decorate（fun) fun(1,2) 若decorate有参数则相当于 fun=decorate（参数）（fun）若装饰类则一样的，更新方法、属性。同样的是name 阅读全文

posted @ 2018-05-27 16:14 BioinformaticsMaster 阅读(257) 评论(0) 推荐(0) 编辑

python egg包类似jar，都是以zip为基础的，.egg结尾的文件

摘要： python egg包类似jar，都是以zip为基础的，.egg结尾的文件，作为bundles for distributing code 。一个 “python egg “ 是一个python项目的逻辑结构，由代码、resources、metadata组成。 egg的关键原则是可发现（disc 阅读全文

posted @ 2018-05-16 23:55 BioinformaticsMaster 阅读(2159) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Java 在Ubuntu 安装

摘要：安装Java 8 ( 支持 Ubuntu 10.04 - Ubuntu 16.04 ) 1、如果你在 Ubuntu 软件中心安装过 OpenJDK，请先使用如下命令将其删除： sudo apt-get purge openjdk* 2、添加 PPA 源 sudo add-apt-repository 阅读全文

posted @ 2018-05-16 09:25 BioinformaticsMaster 阅读(152) 评论(1) 推荐(0) 编辑

python @property 将类的方法转化为属性读取并赋值

摘要： @property 将类方法转化为类属性调用。 >>> person = Person("Mike", "Driscoll")>>> person.full_name'Mike Driscoll'>>> person.first_name'Mike'>>> person.full_name = "J 阅读全文

posted @ 2018-05-16 00:27 BioinformaticsMaster 阅读(242) 评论(0) 推荐(0) 编辑

python 变量解压赋值

摘要： * 数组 ** 字典如 >>> d = dict(a=4,b=5,c=6) >>> test(**d) 重要参考：https://blog.csdn.net/zvall/article/details/79052576 阅读全文

posted @ 2018-05-16 00:10 BioinformaticsMaster 阅读(196) 评论(0) 推荐(0) 编辑

fnmatch 优点在于 linux shell通配符

摘要： fnmatch模块：优点在于提供对Unix Shell通配符的支持 Pattern Meaning * matches everything ? matches any single character [seq] matches any character in seq [!seq] match 阅读全文

posted @ 2018-05-11 00:43 BioinformaticsMaster 阅读(153) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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