CMplot 可视化曼哈顿，qqplot
摘要：library(CMplot) setwd("~/literature/recurring/manhat_qplot") df<-read.table("GCST90014052_buildGRCh38.tsv.gz",header=T,sep="\t") df_column<-df %>%sele
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posted @ 2022-04-29 11:06
04 2022 档案
PRS 多基因风险评估
摘要：•复杂疾病往往是多基因遗传（polygenic）的结果，即需要通过多个对性状贡献较小的基因来解释。 •多基因风险评分-Polygenic risk scores （PRS）是通过聚合并量化许多常见变异来预测个体某疾病的遗传易感性。 •基于GWAS鉴定出的易感基因以及潜在相关的风险位点,并结合一些非基
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posted @ 2022-04-20 11:31
肾病质控下机数据的脚本
摘要：library("tidyverse") library(ggplot2) library(ggpubr) data <- read_tsv("./rawDataStat20220215141517.txt") #fq qc dataPlot<-data %>% select("TotalBases
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posted @ 2022-04-14 11:03
rawdata0413<-read.csv("./rawDataStat20220413151324.txt",sep = "\t") 不等于read.tsv
摘要：文件内有%，rawdata0413<-read.csv("./rawDataStat20220413151324.txt",sep = "\t")识别错误 rawdata0413<-read.csv("./rawDataStat20220413151324.txt",sep = "\t") 里边的%
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posted @ 2022-04-13 17:42
conditional analysis 把发现的lead SNP作为协变量看LD内是否有其他显著SNP
摘要：plink -condition https://zhuanlan.zhihu.com/p/363026493 https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/10278893.html
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posted @ 2022-04-12 09:41
解决网页复制限制
摘要：解决方法：谷歌浏览器安装Enable Copy 扩展程序。 1. 需要解除限制时，点击Enable Copy 那个对勾图标，此时图标会从浅灰色变为深灰色，当前网页和该网站下的所有网页都被解除限制。 2. 再次点击图标会变回浅灰色，以后再打开该网站的网页时，将不会被自动解除限制。
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posted @ 2022-04-09 10:02
知网下载pdf格式
摘要：知网的硕博论文下载时候常只提供caj格式，这种格式很不利于编辑，也不利于跨平台。 那要下载pdf格式： 1.点击ENGLISH转换成英文版 2.搜索要查询的论文题目，然后就可以下载pdf了 附对比中文版查询结果
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posted @ 2022-04-08 20:27
英文拼写检查
摘要：1. Grammarly 网页端装插件、本地desktop一起联动使用。 实在不行，通过网页登陆https://app.grammarly.com/ddocs/1238360813 网页端如谷歌翻译时可以一直用，本地大量写论文时，建议写完再检查，不然容易分心在小语法上。 2. Postwriting
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posted @ 2022-04-01 21:39
记测评文章
摘要：开展前需比较充分调研文献，对当前进展思考 根据项目，确定文章架构，各部分要填充的东西部署下去，推动进展。 开始写着，不必万事俱备，越写越确定，空缺模块就待填充，没关系。 有一点不足就是自己的写法句型需要更多样，更native, 这建议从文章修改，平时遇到很好的模范句型，https://www.the
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posted @ 2022-04-01 14:28
