02 2018 档案

Biopython SeqIO 读取序列文件,读取信息,写入序列
摘要:Biopython1.序列赋值 转录(反转录) 翻译 反向互补2.读取序列文件,识别序列的属性信息。SeqRecord提供序列及其注释的容器属性:seq :一条生物序列id:基本ID,标识这条序列name:常用分子的名称description:序列分子的描述letter_annotation:是一个 阅读全文

posted @ 2018-02-12 10:56 BioinformaticsMaster 阅读(5992) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Biopython 模块处理Seq序列 方法
摘要:Biopython 模块1.序列 赋值 Bio.Alphabet.IUPAC 提供蛋白质、DNA和RNA的基本定义,并提供扩展和定制基本定义的功能。1.1 DNA 字母表 基本字母:IUPACUnambiguousDNA每种可能下的歧义字母:IUPACAmbiguousDNA修饰后的碱基:Exten 阅读全文

posted @ 2018-02-11 23:52 BioinformaticsMaster 阅读(5666) 评论(0) 推荐(0) 编辑

coursera 有比较丰富的生物信息等课程 win7 访问设置
摘要:1.打开网址https://www.coursera.org 注册,然后搜索想要学习的课程,不需要证书则免费 2.若视频一直缓冲或显示黑屏则需要修改C:\Windows\System32\drivers\etc\host文件,添加如下一行: 52.84.246.72 d3c33hcgiwev3.cl 阅读全文

posted @ 2018-02-10 11:10 BioinformaticsMaster 阅读(251) 评论(0) 推荐(0) 编辑

python 正则匹配 csv文件中特殊符号如■高风险 这样的black block
摘要:各种符号必然在unicode中有保存,根据unicode代码匹配即可。 1.csv中特殊字符可以在excel的【插入符号】中查找,然后记下该符号的Unicode代码。如■ 这个实心方形的Unicode代码为25A0: 2.需要查询其他的代码可以以此代码为基础搜索,(当然本例用词代码即可):如unic 阅读全文

posted @ 2018-02-03 18:33 BioinformaticsMaster 阅读(685) 评论(0) 推荐(0) 编辑

一段时间即可做一些事情,如二十分钟
摘要:一些时间即可做一些事情,如二十分钟 阅读全文

posted @ 2018-02-03 14:55 BioinformaticsMaster 阅读(129) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Git 简介和下载安装
摘要:Git 简介: Git 是处理文本文件的版本管理系统。 Github获取Git的提交历史,并保存在互联网,以供远程(联网)访问。 工作过程: 1)创建本地分支,在本地分支编辑,修改,提交。 2)push到远程分支 3)申请merge到主分支,发布请求 Pull Request 4)审核merge 5 阅读全文

posted @ 2018-02-02 17:08 BioinformaticsMaster 阅读(184) 评论(0) 推荐(0) 编辑

python 读取其他文件的变量 import 或 正则读取
摘要:例:从 ref.py 读取 路径变量 ref.py: 则 1)可在目前的run.py: 2)也可以通过正则读取变量值, 阅读全文

posted @ 2018-02-01 14:42 BioinformaticsMaster 阅读(3363) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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