2017年9月29日

使用de Bruijn graph组装基因组的时候,Kmer数为何必须是奇数呢

摘要: 因为如果kmer是偶数,我们会发现基因组上有些序列(如,CGCGCGCG, kmer=4)的Kmer在反向互补后得到的序列仍然是它自身!而这是不能允许的,因为这将导致你无法区分某段序列的kmer到底是属于它自身还是说只是来自于它的互补链!!这将会给解组装的de Bruijn graph带来极大的困难 阅读全文

posted @ 2017-09-29 16:03 BioinformaticsMaster 阅读(1385) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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