使用de Bruijn graph组装基因组的时候，Kmer数为何必须是奇数呢
摘要：因为如果kmer是偶数，我们会发现基因组上有些序列（如，CGCGCGCG， kmer=4）的Kmer在反向互补后得到的序列仍然是它自身！而这是不能允许的，因为这将导致你无法区分某段序列的kmer到底是属于它自身还是说只是来自于它的互补链！！这将会给解组装的de Bruijn graph带来极大的困难
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posted @ 2017-09-29 16:03
09 2017 档案
Linux Shell t特殊变量 $0 $@ $# $_ $?
摘要：$0: 执行脚本的名字 $*和$@: 将所有参数返回 $#: 参数的个数 $_: 代表上一个命令的最后一个参数 $$: 代表所在命令的PID $!: 代表最后执行的后台命令的PID $?: 代表上一个命令执行是否成功的标志，如果执行成功则$? 为0，否则不为0
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posted @ 2017-09-28 14:33
SOAPnuke 1.5.6
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posted @ 2017-09-26 15:52
