Sambamba 安装 ,软件加入PATH使各级路径都可运行,所谓环境变量

 

最简单的方式是下载编译后的软件:*.static.gz

1.如: wget https://github.com/biod/sambamba/releases/download/v0.7.1/sambamba-0.7.1-linux-static.gz
2.gunzip sambamba-0.7.1-linux-static.gz
3.chmod +x sambamba-0.7.1-linux-static
4. mv ./sambamba-0.7.1-linux-static ./sambamba
5.echo $PATH #查看已加入PATH中的路径(shell将到哪些目录中寻找命令或程序,PATH的值是一系列目录,当您运行一个程序时,Linux在这些目录下进行搜寻编译链接)
  然后1)可以把软件链接到已有路径下 2)把软件路径加入$PATH
6.这里,把软件链接到已有$PATH下的路径,ln -s /opt/bin/olympus_tools/sambamba/sambamba /usr/local/bin/
7.测试输入 sambamba ,已经OK

补充
给$PATH 新添目录路径时如果认为常用,则在~/.bashrc加入,软件冷门则在调用该软件脚本中加入,都是export PATH=$PATH:$softwaredir


posted on   BioinformaticsMaster  阅读(926)  评论(0编辑  收藏  举报

编辑推荐:
· 基于Microsoft.Extensions.AI核心库实现RAG应用
· Linux系列:如何用heaptrack跟踪.NET程序的非托管内存泄露
· 开发者必知的日志记录最佳实践
· SQL Server 2025 AI相关能力初探
· Linux系列:如何用 C#调用 C方法造成内存泄露
阅读排行:
· 震惊!C++程序真的从main开始吗?99%的程序员都答错了
· 【硬核科普】Trae如何「偷看」你的代码?零基础破解AI编程运行原理
· 单元测试从入门到精通
· 上周热点回顾(3.3-3.9)
· winform 绘制太阳,地球,月球 运作规律

导航

< 2025年3月 >
23 24 25 26 27 28 1
2 3 4 5 6 7 8
9 10 11 12 13 14 15
16 17 18 19 20 21 22
23 24 25 26 27 28 29
30 31 1 2 3 4 5
点击右上角即可分享
微信分享提示