按_1 _2 排序fqlist 递归去空格
摘要：# -*- coding: utf-8 -*- # @Time : 2022/2/10 上午10:08 # @Author : lizhichao # @Email : 13652030758@163.com # @File : sort_Fqfile.py # @Software: PyCharm
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posted @ 2022-02-10 11:51
随笔分类 - python
顺序的fqlist拆解成sample fqsize fq格式 ，涉及正则取样本名
摘要：# -*- coding: utf-8 -*-# @Time : 2022/1/20 下午10:10# @Author : lizhichao# @Email : 13652030758@163.com# @File : sample_fqsize_fq.py# @Software: PyCharm
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posted @ 2022-02-10 11:49
python 好用的分隔字符串，切片，pop
摘要：linelist=line.rstrip().split(",") # 去掉末尾空白符（空格 换行）后，按,分成列表 切片 linelist[i:j] 取linelist[i]到linelist[j-1] #[]内为索引 缺省i ，默认为0，即从起始元素开始，如linelist[:j] 缺省j, 默
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posted @ 2022-01-06 14:33
python stderr.write() 和print()/stdout.write()不一个出口
摘要：print()默认情况下，和stdout.write()一个出口，区别是print()自带换行 stderr.write()另一个出口 1) 定义测试python脚本 import sys print ("print") sys.stdout.write("stdout") sys.stderr.w
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posted @ 2022-01-04 16:46
python 遍历大文件，处理数据时，时时把变量保存到文件，不增大变量，节省内存
摘要：# 多用write()def split_file(infile, n_parts, outdir): if not os.path.exists(infile): sys.stderr.write("Error: Can't find file: %s\n" % infile) sys.exit(
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posted @ 2022-01-04 15:53
测试csvkit 操作csv
摘要：安装： virtualenv csvhandlesource csvhandle/bin/activate pip install csvkit cd csvhandle mkdir testcd test 测试：软件在对转码方面做的不到位。 ../bin/in2csv 不能转换含中文的excel到
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posted @ 2021-11-25 19:45
管理不同版本的python用pyenv, 管理环境变量装包用virtualenv
摘要：1. 管理不同版本的python,如python2,python3。 python版本维度。 pythonbrew不再维护 用pyenv brew install pyenv 2.管理同一python版本下不同的环境变量。 项目维度： 2.1 virtualenv 所要解决的是同一个库（包）不同版本
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posted @ 2021-11-25 16:57
less 文件少一行， python -join -write ,shell 逐行读取
摘要：用python file.write("\n".join(line_list)) 方式将多行内容组成的列表写入文件。文件末行没有换行符， 因此vi打开文件会因为如同window系统一般的文件结尾，提示：[noeol] 且，less |wc-l 的方式数行数会比实际行数少一行。 这样的输出文件用pyt
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posted @ 2020-03-03 12:14
mac系统安装 python包
摘要：mac 虽然自带python，但是并没有自带pip等这样的管理包。 1.brew install pip 安装pip 时，报错： Error: No available formula with the name "pip" pip is part of the python formula: br
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posted @ 2019-06-23 21:13
JetBrains产品激活
摘要：本文适用于所有 JetBrains 系列产品 亲测 方法二队DataGrip可用。 方法一、最新方法Jet Brains家族破解方法 方法二、本方法来自网络 原文地址 http://xidea.online
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posted @ 2018-06-08 15:44
Python装饰器 name binding
摘要：python 装饰器 函数或方法 @decorate def fun(a,b): ... fun(1,2) 时即 fun=decorate（fun) fun(1,2) 若decorate有参数则相当于 fun=decorate（参数）（fun） 若装饰类 则一样的，更新方法、属性。 同样的是name
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posted @ 2018-05-27 16:14
python egg包类似jar，都是以zip为基础的，.egg结尾 的文件
摘要：python egg包类似jar，都是以zip为基础的，.egg结尾 的文件，作为bundles for distributing code 。 一个 “python egg “ 是一个python项目的逻辑结构，由代码、resources、metadata组成。 egg的关键原则是可发现（disc
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posted @ 2018-05-16 23:55
python @property 将类的方法转化为属性读取并赋值
摘要：@property 将类方法转化为类属性调用。 >>> person = Person("Mike", "Driscoll")>>> person.full_name'Mike Driscoll'>>> person.first_name'Mike'>>> person.full_name = "J
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posted @ 2018-05-16 00:27
python 变量解压赋值
摘要：* 数组 ** 字典 如 >>> d = dict(a=4,b=5,c=6) >>> test(**d) 重要参考：https://blog.csdn.net/zvall/article/details/79052576
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posted @ 2018-05-16 00:10
fnmatch 优点在于 linux shell通配符
摘要：fnmatch模块： 优点在于提供对Unix Shell通配符的支持 Pattern Meaning * matches everything ? matches any single character [seq] matches any character in seq [!seq] match
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posted @ 2018-05-11 00:43
pycharm 代码块缩进、左移
摘要：1、pycharm使多行代码同时缩进 鼠标选中多行代码后，按下Tab键，一次缩进四个字符 2、pycharm使多行代码同时左移 鼠标选中多行代码后，同时按住shift+Tab键，一次左移四个字符 鼠标选中多行代码后，按下Tab键，一次缩进四个字符 2、pycharm使多行代码同时左移 鼠标选中多行代
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posted @ 2018-05-10 16:19
os.popen(cmd) .read() 获取执行后的结果且带有换行符\n
摘要：os.popen(cmd) .read() 获取执行后的结果自动带有换行符\n >>> a=os.popen("ls ./soapnuke_output/CL100006359_L01_8 |wc -l")>>> a<open file 'ls ./soapnuke_output/CL1000063
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posted @ 2018-04-14 09:59
