05 2019 档案

在ubuntu中搜索文件或文件夹的方法
摘要：1. whereis+文件名 用于程序名的搜索，搜索结果只限于二进制文件（参数-b）、man说明文件（参数-m）和源代码文件（参数-s），如果省略参数，则返回所有信息。 2. find / -name +文件名 find是在指定的目录下遍历查找，如果目录使用 / 则表示在所有目录下查找，find方式 阅读全文
posted @ 2019-05-17 09:48 Raymone1125 阅读(6865) 评论(0) 推荐(1) 编辑
从PubMed的HTML页面提取标题和摘要文本
摘要：#Author：Alex.Zhang import urllib.request import re pmids=['18235848','18235847','18235849'] count=0 for pmid in pmids: count+=1 url='https://www.ncbi. 阅读全文
posted @ 2019-05-03 08:00 Raymone1125 阅读(1036) 评论(0) 推荐(0) 编辑
PDB(Protein Data Bank)数据格式详解
摘要：PDB(Protein Data Bank)是一种标准文件格式, 其中包含原子的坐标等信息, 提交给 Protein Data Bank at the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) 的结构都使用这种标准格式. 阅读全文
posted @ 2019-05-02 20:34 Raymone1125 阅读(9294) 评论(0) 推荐(0) 编辑
用python绘制质粒图谱
摘要：#Author：Alex.Zhang from PIL import Image, ImageDraw,ImageFont import math #创建一个图像 PLASMID_LENGTH = 4361 SIZE = (500, 500) CENTER = (250, 250) #‘RGB’表示该图像采用红绿蓝配色方案，元组size取值(500, 500) # 在RGB中，红色（255,0，... 阅读全文
posted @ 2019-05-02 19:27 Raymone1125 阅读(995) 评论(0) 推荐(0) 编辑
编写格式良好的代码
摘要：1.应在逗号和学术运算符号后面加一个空格 2.函数中变量名应该小写 3.模块中常用的变量名应该大写 4.每个函数后面应该空两行 5.每个函数都要有解释的文档注释字符串 整体上这样编码是很好的，最主要的是可以给自己或者其他帮助者提供一定的理解。 阅读全文
posted @ 2019-05-02 19:10 Raymone1125 阅读(195) 评论(0) 推荐(0) 编辑
linux常用指令大全（持续更新中）
摘要：查看电脑配置命令 查看内核/操作系统/CPU信息：uname -a 查看CPU信息：cat /proc/cpuinfo 查看内存使用：free -m 查看防火墙：sudo iptables -L 查看防火墙状态：sudo ufw status 开启/关闭防火墙：sudo ufw enable|dis 阅读全文
posted @ 2019-05-02 08:16 Raymone1125 阅读(171) 评论(0) 推荐(0) 编辑
python通过pip安装第三方库到指定位置
摘要：比如说我要安装一个Rpy，在Windows下是这样的： pip install -t F:\anaconda\Lib Biopython 黄色的是你的安装路径，橙色的是你要安装的库。 阅读全文
posted @ 2019-05-02 07:40 Raymone1125 阅读(5420) 评论(1) 推荐(1) 编辑