通过 ssh 配合conda 在 Linux服务器 使用 R语言
摘要:
我们使用vs code运行R语言代码. 参考教程:用 Conda 管理 R 环境并配合 VS Code 优化数据分析代码体验 ssh连接 conda配置 默认都会 ssh连接教程:VS Code / Pycharm配置SSH远程开发(免密登录) conda配置教程:纯小白 远程Linux服务器无ro
数据结构 链表and顺序表
摘要:
链表 7-3 单链表的创建,遍历与销毁 从键盘输入任意多个正整数,输入以-1结束。逆序输出这些整数(不包括-1)。 提示: 1、逆序创建单链表。结点数据域是整型数。每输入一个整数,向链表中插入一个结点。当输入-1时结束链表的创建。 2、遍历链表,输出结点数据域的值。 3、遍历完成后,要求销毁该链表。
求解
摘要:
好的,我将按照你的要求,将之前的回复中的``````和``,替换成$,并重新整理一下,以期更清晰地呈现: 拉格朗日乘子法在GMM中的应用:详细解析 问题回顾 我们希望在约束条件下,最大化如下拉格朗日函数: \[L = \sum_{n=1}^N \s
机器学习相关作业/公式应用
摘要:
work4 证明函数是否是凸函数 题目:要求证明两个性质: Logistic函数 对参数 是非凸的。 对数似然函数 \(L(\beta) = -y_0
机器学习
摘要:
一、绪 论 启发式小故事: AlphaGo 理论 算法 数据 建模 对策 学习16万局业余棋手比赛 AlphaGo Zero 3天后: 100:0 超越AlphaGo Lee 21天后:达到AlphaGo Master 40天后:超过所有之前的版本 Thoughts about AlphaGo Ze
单细胞 RNA 测序(scRNA-Seq)分析一条龙(入门)
摘要:
工具准备 R语言:Linux下无root权限安装R语言(conda安装和普通安装) python:conda安装 cellranger:后面用到会说 概述/扫盲 什么是单细胞 RNA 测序(scRNA-Seq)数据? 单细胞 RNA 测序(single-cell RNA seq,scRNA-Seq)
单细胞数据_不同类型的数据介绍与Scanpy读取
摘要:
(单细胞下游分析——存储方式汇总,不同类型的数据读入) 数据读入采取scanpy库进行:scanpy库是用于单细胞数据分析的 Python 库 下面几种数据存储的核心数据都是一样的,只是格式不同。 .h5ad(anndata 数据格式) .h5ad数据结构解释(anndata 数据格式) 官方网站:
torch.nn.Embedding的导入与导出
摘要:
简介及导入转自:torch.nn.Embedding使用 在RNN模型的训练过程中,需要用到词嵌入,使用torch.nn.Embedding可以快速的完成:只需要初始化torch.nn.Embedding(n,m)即可(n是单词总数,m是词向量的维度)(n是嵌入字典的大小,m是嵌入向量的维度。)。
scanpy计算n_genes_by_counts和total_counts等质量控制指标
摘要:
利用scanpy的calculate_qc_metrics函数计算adata的obs中的质量控制指标(n_genes_by_counts,total_counts等参数指标) ⚠️注意:只是计算相关质量控制指标,并不会筛选/过滤数据。 类似代码:Dandelion库的ddl.pp.recipe_sc
conda常用命令
摘要:
增删基本命令 创建虚拟环境: # 创建pyhon=3.8的版本环境,取名叫 my_env conda create -n my_env python=3.8 删除虚拟环境(谨慎操作) conda remove -n my_env --all 激活环境 conda activate my_env 安装