摘要：
Namd2-gpu +p20 +devices 0,1,2,3 test.conf > test.log charm_run ++nodelist nodelist namd_2 +p80 ++ppn 20 ../../../ante/allff3/complex_popc/namd/prod_te 阅读全文
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摘要：
Namd2-gpu +p20 +devices 0,1,2,3 test.conf > test.log charm_run ++nodelist nodelist namd_2 +p80 ++ppn 20 ../../../ante/allff3/complex_popc/namd/prod_te 阅读全文
摘要：
首先应该注意区分序列相似性与序列同源性的关系，序列相似不一定同源，但是判定同源性关系的时候有些算法（Maximum likelihood除外）要考虑到序列相似性。序列相似性是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较，用于确定该序列的生物属性，也就是找出与此序列相似的已知序列是什么，完成这一工作只需 阅读全文
摘要：
Note from> http://jerkwin.github.io/GMX/GMXtut-1/ 1、生成拓扑 >gmx_mpi pdb2gmx -f pro2.pdb -o pro2.gro -water TIP3P >5 2、检查拓扑 3、定义单位盒子并填充溶剂 >gmx_mpi editco 阅读全文
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*一些操作： 运行R脚本：source (“Rscript”) 当前目录下的文件：dir() *画图 ########R语言画图 ###RMSD getwd() file <- read.csv("backbone_rmsd.csv",sep='',header = FALSE) options(m 阅读全文
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一、Snapshot（用不同颜色显示蛋白不同二级结构，用不同颜色显示不同小分子，显示连键） >load name.pdb,name #>fetch object #>disable object-name #>enable object-name #>delete selection-name #> 阅读全文
摘要：
4、想要在windows下查看每个文件夹的存储占用，可以下载使用Folder Size Explorer 软件 3、Cmd知识 1、 chdir == pwd 2、 想要切换到d盘，直接输入d：就行 3、 改变命令行字体颜色：color[1,2,3…],改变背景和字体color[11,12,23.. 阅读全文
摘要：
使用密钥登录（不使用密码）1、首先生成密钥，在任意目录下输入命令：ssh-keygen -t rsa -P ''-P表示密码，-P ''表示空密码之后系统会提示输入生成的密钥文件的文件名，可以输入任意名称，比如id_rsa，回车系统会在当前目录下生成id_rsa与id_rsa.pub两个文件2、在根 阅读全文
摘要：
以前在linux上没有使用分屏操作，有些时候需要打开两个终端，还得把他们对齐，甚是不方便 相比于tmux需要记一些简单的快捷命令，terminator甚至连快捷命令都不用记，相当于windows的软件，右键就有分屏操作 不过安装好需要自己设置一下显示方式，字体、背景等等 字体选择ubuntu Mon 阅读全文
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