计算之道

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2021年1月7日

摘要: 这两天学院非要搞拨号上网,由于我只有一个学号,导致主机和虚拟机只能有一个拨号上网;或者是主机拨号,虚拟机使用NAT(网络地址转换)联网,不过这样的话虚拟机就无法设置静态ip,以至于无法连接打印机。不过幸好发现我之前的学号还能使用,所以最终的解决方案是:主机使用一个学号拨号上网;虚拟机网络使用桥接,然 阅读全文
posted @ 2021-01-07 09:56 计算之道 阅读(768) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年12月20日

摘要: 本来觉得挺简单一操作,谁知道竟还是浪费了些时间在这(被gaussian09坑了),遂记录一下。 拟合RESP电荷目前知道的方法有使用gaussian和antechamber拟合RESP电荷,以及Multiwfn拟合RESP电荷(很简单也很方便,参考Sob大神写的http://sobereva.com 阅读全文
posted @ 2020-12-20 12:58 计算之道 阅读(4171) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年11月26日

摘要: 说来惭愧,这两个玩意儿用了几年了,闭着眼睛竟然写不出来公式,忙了几天现在抽出时间了,闭着眼睛写一下。 RMSD,Root Mean Square Deviation,均方根偏差;RMSF,Root Mean Square Fluctuation,均方根波动。 在轨迹分析中,最经常用,最简单,也最有用 阅读全文
posted @ 2020-11-26 15:56 计算之道 阅读(7289) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年10月31日

摘要: 尝试将机器1的虚拟中的windows7系统转移到机器2上,之前采用的方法是直接拷贝.vdi文件。但是如果存在备份的话,可能是两个.vdi文件共同在作用,所以不好整。 最简单明了且有效的方法: 1,机器1的虚拟机上,点管理--导出虚拟电脑,得到.ova文件 2,然后在机器2的虚拟机上,点管理--导入虚 阅读全文
posted @ 2020-10-31 17:32 计算之道 阅读(185) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年8月13日

摘要: 5、一些短脚本 (9)计算平均氢键数量,以及平均界面面积 ##hbondhb_ave=$(awk 'NR > 1 {sum += $2 + $3} END {if (NR > 1) print sum / (NR - 1)}' "HB.dat")echo "average of H_bond: $h 阅读全文
posted @ 2020-08-13 10:52 计算之道 阅读(187) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年6月1日

摘要: 开机出现windows boot manager提示,系统引导除了问题,系统进不去 提示为 windows\system32\winload.exe 损坏或者丢失 网上给出了很多解决方案,最多的就是重装系统,但是不想那么麻烦,于是去老毛桃官网 https://www.laomaotao.net/do 阅读全文
posted @ 2020-06-01 11:54 计算之道 阅读(1329) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年4月15日

该文被密码保护。 阅读全文
posted @ 2020-04-15 00:39 计算之道 阅读(6) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年4月4日

该文被密码保护。 阅读全文
posted @ 2020-04-04 15:56 计算之道 阅读(0) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年3月5日

摘要: 1>内存释放问题 使用atomselect函数在vmd中选择原子$a后,占用了大量的内存空间。如果是在循环中频繁使用,务必记得使用 $a delete 命令释放内存。 阅读全文
posted @ 2020-03-05 18:31 计算之道 阅读(255) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2020年2月7日

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posted @ 2020-02-07 18:39 计算之道 阅读(3) 评论(0) 推荐(0) 编辑