计算之道

摘要： 最近使用conda 突然出现了这个问题： Error while loading conda entry point: conda-libmamba-solver (No module named 'libmambapy.bindings') 网上看了很多方法，尝试后都没有解决。 最后，在执行以下命 阅读全文

摘要： 想要使用pymol将cif转换为pdb，又不想每次都打开pymol的图形界面，于是想通过命令行操作pymol来实现： 首先，执行命令行中的python，发现python的环境中没有pymol模块，因此需要将 PyMOL 的模块路径添加到 PYTHONPATH： 在环境变量中添加并source： ex 阅读全文

摘要： 一、convert生成gif报错 问题： 执行 convert -delay 12 -loop 1 *jpg ./DI4_z1.gif 报错：convert-im6.q16: cache resources exhausted `./DI4_z1.gif' @ error/cache.c/OpenP 阅读全文

摘要： 一、拓扑+坐标结构转换 1. 利用Acpype ：Amber 转gromacs（gromacs第一个教程上推荐的） acpype -p comp.prmtop -x comp.inpcrd comp.prmtop以及comp.inpcrd 是利用Amber构建好的文件，输入上述命令 ，生成solva 阅读全文

摘要： mrc3@wanglab-node3:~$ sudo apt install dkmsReading package lists... DoneBuilding dependency tree... DoneReading state information... DoneSome packages 阅读全文

摘要： 一、新建和保存 阅读全文

摘要： 综合，偏材料，偏化学，计算传统期刊1梯度：PNAS，Science Advances，Nature Chemistry，Nature Communication，JACS，Angew，Chem，Advanced Science，NAR2梯度：Chemical Science，Small，ACS Na 阅读全文

摘要： scaler = StandardScaler().fit(X_train)X_train_scaled = scaler.transform(X_train)X_val_scaled = scaler.transform(X_val)和scaler = StandardScaler() X_tra 阅读全文

摘要： ##Code Description: Statistics of attendance records（基于从打卡机导出的Excel表格，统计每个人每天的打卡时长，以及总打卡时长，将结果放入一个新的Excel表中）##Author: RuichaoMao##Date: 4-16-2024impor 阅读全文

摘要： 原文章链接（侵删）：https://bohrium.dp.tech/notebooks/9747927953 在完成分子动力学模拟之后，需要对模拟轨迹进行分析，计算径向分布函数（Radial Distribution Function, RDF）即是一种常见的分析。大多分子动力学模拟软件提供了计算R 阅读全文