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2018年1月22日 #

PacBio下机数据如何看？

摘要： 一开始拿到三代测序的下机数据时，蒙了，readme ？三代测序的下机数据都有哪些，以及他们具体的格式是怎么样的（以sequel 平台为主）。 测序过程 SMRTbell A adapter通用接头，两端的接头可以一样也可以不一样 B barcode(客户自己设计) I insert 插入片段，即我们 阅读全文

posted @ 2018-01-22 14:21 YZ_JinHH 阅读(9268) 评论(0) 推荐(0) 编辑

人类基因组三代组装： cano

摘要： git clone https://github.com/marbl/canu.git cd canu/src make -j 使用实例： canu -p prefix_name -d /CloudHealth/softwares/canu/Linux-amd64/bin genomeSize=3g -pacbio-raw subreads.fastq gnuplotTest... 阅读全文

posted @ 2018-01-22 11:21 YZ_JinHH 阅读(453) 评论(0) 推荐(0) 编辑