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2017年11月27日 #

基因组共线性分析方法

摘要： # 版本1 链接地址：http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/ 作者： wyp 版本：Perl # 版本2 链接地址：http://chibba.agtec.uga.edu/duplication/mcscan/ 作者：唐海宝 （福建农林大学） 海峡联合研究院： htt 阅读全文

posted @ 2017-11-27 17:49 YZ_JinHH 阅读(6495) 评论(0) 推荐(0) 编辑

认识一下生物信息领域的文件格式

摘要： # interproscan 提到的格式 TSV 是Tab-separated values的缩写，即制表符分隔值。 CSV，Comma-separated values（逗号分隔值）。 注意：IANA规定的标准TSV格式，字段值之中是不允许出现制表符 Python对TSV文件的支持： Python 阅读全文

posted @ 2017-11-27 15:59 YZ_JinHH 阅读(510) 评论(0) 推荐(0) 编辑

RNA分析要点

摘要： 1. 有参与无参转录组分析 2. lncRNA分析 以RNA-Seq测序技术为基础的转录组测序作为高通量测序时代核心技术之一，已在生物科学及医学领域前沿研究中获得广泛应用。RNA-Seq可进行全基因组水平的基因表达差异研究，具有定量更准确、可重复性更高、检测范围更广、分析更可靠等特点，真核生物的基因 阅读全文

posted @ 2017-11-27 10:27 YZ_JinHH 阅读(517) 评论(0) 推荐(0) 编辑

circos 绘制关系型图ribbon，并加入透明度

摘要： luminance = lum80<<include colors_fonts_patterns.conf>><colors># r,g,b,a color definition# a = 0 fully opaque# a = 1 fully transparent</colors><<inclu 阅读全文

posted @ 2017-11-27 10:16 YZ_JinHH 阅读(1619) 评论(0) 推荐(0) 编辑

蛋白序列GO号注释及问题

摘要： # 版本1 InterProScan的三种使用方法Interproscan,通过蛋白质结构域和功能位点数据库预测蛋白质功能。是EBI开发的一个集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余数据库。Interproscan整合了一些使用最普及的一些数据库，并应用于功能未知的蛋白进行Interpro注释和G 阅读全文

posted @ 2017-11-27 10:10 YZ_JinHH 阅读(1547) 评论(0) 推荐(0) 编辑