WRF WPS多核并行运行

WRF运行前，需要利用WPS程序先对数据进行预处理，包括ungrib，geogrid和metgrid。其中，ungrib和geogrid可以独立运行。metgrid的运行依赖ungrib和geogrid的输出结果。

geogrid和megrid可以多核并行运行，生成的文件将按照并行数目N进行拆分，每个时次N个文件；ungrib是单核运行，每个时次仅一个文件。此后，的WRF程序运行时，需要CPU的核数需要与之前metgrid并行数目一致（即WRF程序real.exe, wrf.exe并行数目和拆分的metgrid文件数一致）。

geogrid和metgrid不一定都要并行，比如geogrid可以串行执行，但metgrid的运行必须多核运行（如果后面WRF也想开启分布式运行的话）。

 

具体步骤：

1. 修改namelist.wps，以下选项进行设置

io_form_geogrid = 102,

io_form_metgrid = 102,

然后并行运行ungrib,geogrid和metgrid

./ungrib.exe

mpirun -np 64 ./geogrid.exe

mpirun -np 64 ./metgrid.exe

分别将geogrid和metgrid进行拆分。

由于metgrid.exe有bug，在并行运行是，对于每个时次拆分的的met_em.d*文件，只有拆分的第一个文件的属性NUM_LAND_CAT为正确值，其他文件的NUM_LAND_CAT为0，这将造成后续运行real.exe出现错误，所以，需要先用nco命令，将met_em.d*文件的NUM_LAND_CAT属性的值设置成一致

#!/bin/bash
for fname in met_em.d0*
do
        echo "Working on $fname"
        ncatted -O -a NUM_LAND_CAT,global,o,i,28 $fname
done

其中上面的28要改成实际文件的NUM_LAND_CAT数目。

ls met*_.nc_0000| ncdump -h |grep -i NUM_LAND_CAT

 

2. 修改namelist.input

 io_form_auxinput1 = 102

运行real.exe

mpirun -np 64 ./real.exe

运行wrf.exe

mpirun -np 64 ./wrf.exe 

注意上述的红色数字为并行的数目，需要保持一致。

 

参考：https://forum.mmm.ucar.edu/threads/pnetcdf-capability-for-wps.12607/#post-30170

https://forum.mmm.ucar.edu/threads/mismatch-between-namelist-and-wrf-input-files-for-dimension-num_land_cat.13541/

https://forum.mmm.ucar.edu/threads/cannot-support-split-netcdf-option-for-real-exe.19038/