【机器学习与R语言】9- 支持向量机

1.理解支持向量机(SVM)

1)SVM特点

  • 支持向量机和神经网络都是“黑箱模型”的代表:潜在的模型基于复杂的数学系统,而且结果难以解释。
  • SVM的目标是创建一个平面边界(“超平面”),使得任何一边的数据划分都是均匀的。结合了kNN和线性回归。
  • 几乎适用于所有的学习任务,包括分类和数值预测。

2)用超平面分类

  • 线性可分:可以由一条直线或一个平面进行划分

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  • 最大间隔超平面(MMH):很多线都能对数据点进行分类,但要寻找能使类形成最大间隔的那条线(因为在边界附近点位置的微小变化可能导致某些点落在线之外),支持向量就是每个类中最接近最大间隔超平面的点。所以单独使用支持向量,就能定义最大间隔超平面。

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  • 线性可分条件下,最大间隔超平面要尽可能远离两组数据点的外边界(“凸包”),最大间隔超平面就是两个凸包之间的最短距离直线的垂直平分线,可通过“二次优化”算法实现。

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  • 非线性可分:数据不是线性可分的条件下,使用一个“松弛变量”来创建一个软间隔,允许一些点落在线不正确的一边。

图中字母为松弛项(错误落入点)

  • 非线性可分中的成本参数C:即所有违反约束的点,试图使总成本最小,而非寻找最大间隔。修改C将调整对于落在超平面错误一边的案例的惩罚。C越大,实现100%分离的优化就越困难。较小的C将把重点放在更宽的整体边缘。

3)对非线性空间使用核函数

  • 另一种处理非线性问题的方法,就是使用“核技巧”的处理将问题映射到一个更高维的空间,这样非线性关系可能会变为完全线性。

核技巧示例:新维度(海拔高度)使得类完全线性可分

  • 从本质上讲,核技巧涉及一个添加能够表述度量特征之间数学关系新特征的过程。
  • 非线性核SVM的特点:

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  • 核函数:线性核函数(特征的点积),多项式核函数(加一个非线性数据变换),S形核函数(类似神经网络的S形激活函数),高斯RBF核函数(类似RBF神经网络)。多数情况下,核函数的选择是任意的,因为性能可能只有轻微的变化。

2. 支持向量机应用示例

使用SVM进行光学字符识别(OCR图像处理):通过将印刷或手写文本转换为电子形式,保存在数据库种来处理纸质文件。

难点:

  • 图像的规则模式很难严格定义
  • 图像数据往往是噪声数据

1)收集数据

数据集包含26个大写英文字母的2000个案例,使用20种不同的随机重塑和扭曲的黑斯和白色字体印刷。
假设当图像字符被扫描到计算机,转换为像素,有16个统计属性(如水平垂直尺寸,黑色像素比例等)。
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数据下载:

链接: https://pan.baidu.com/s/1q8zHWkMZcapwnX90PA4hOg 提取码: eaqt

2)探索和准备数据

SVM需要所有特征都是数值型的,而且每一个特征需要缩小到一个相当小的区间内。所以不要有因子,而且要做标准化。这里略过没做。

## Example: Optical Character Recognition ----

## Step 2: Exploring and preparing the data ----
# read in data and examine structure
letters <- read.csv("letterdata.csv")
str(letters)

# divide into training and test data
letters_train <- letters[1:16000, ] #80%
letters_test  <- letters[16001:20000, ] #20%

3)训练数据

SVM的R包有e1071,klaR和kernlab等,这里用kernlab(与caret连用,允许SVM使用各种自动化方法进行训练和评估)。

kernlab::ksvm(target~predictors, 
                 data=mydata, 
                 kernel="rbfdot", #隐非线性映射,rbfdot/polydot/tanhdot/vanilladot
                 c=1) #违法约束条件的惩罚,较大的c值导致较窄的边界

训练:

## Step 3: Training a model on the data ----
# begin by training a simple linear SVM
library(kernlab)
letter_classifier <- ksvm(letter ~ ., data = letters_train,
                          kernel = "vanilladot")  #默认使用高斯RBF核函数,这里用线性函数

# look at basic information about the model
letter_classifier

image.png

4)评估模型

letter_predictions <- predict(letter_classifier, letters_test)

head(letter_predictions)

table(letter_predictions, letters_test$letter)

image.png

# look only at agreement vs. non-agreement
# construct a vector of TRUE/FALSE indicating correct/incorrect predictions
agreement <- letter_predictions == letters_test$letter
table(agreement)
prop.table(table(agreement))

image.png
识别的准确度大概为84%。

5)提高性能

可以使用一个更复杂的核函数,将数据映射到更高维的空间,获得一个较好的模型拟合度。如试试高斯RF核函数,或者修改成本约束参数C值来修正决策边界的宽度。

## Step 5: Improving model performance ----
set.seed(12345)
letter_classifier_rbf <- ksvm(letter ~ ., data = letters_train, kernel = "rbfdot") #高斯RBF核函数
letter_predictions_rbf <- predict(letter_classifier_rbf, letters_test)

agreement_rbf <- letter_predictions_rbf == letters_test$letter
table(agreement_rbf)
prop.table(table(agreement_rbf))

image.png

训练时间更长,将准确度提高到了93%。


机器学习与R语言系列推文汇总:
【机器学习与R语言】1-机器学习简介
【机器学习与R语言】2-K近邻(kNN)
【机器学习与R语言】3-朴素贝叶斯(NB)
【机器学习与R语言】4-决策树
【机器学习与R语言】5-规则学习
【机器学习与R语言】6-线性回归
【机器学习与R语言】7-回归树和模型树
【机器学习与R语言】8-神经网络
【机器学习与R语言】9-支持向量机
【机器学习与R语言】10-关联规则
【机器学习与R语言】11-Kmeans聚类
【机器学习与R语言】12-如何评估模型的性能?
【机器学习与R语言】13-如何提高模型的性能?

posted @ 2020-09-08 22:55  生物信息与育种  阅读(1474)  评论(0编辑  收藏  举报