Ubuntu12.04安装R ，Rstudio, RHive

环境：
Ubuntu12.04
R-3.1.0

0.Ubuntu安装R官网的介绍

http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/

Precise Pangolin (12.04; LTS), 

与12.04对应的是

add  deb http://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu precise/in your /etc/apt/sources.list file, replacing<my.favorite.cran.mirror> by the actual URL of your favorite CRANmirror. See http://cran.r-project.org/mirrors.html for the list ofCRAN mirrors. To install the complete R system, use

    sudo apt-get update
   sudo apt-get install r-base

将这行加到 

/etc/apt/sources.list文件，然后用实际的URL替换
<my.favorite.cran.mirror>

总结了一下，有以下三步：

步骤1. 

sudo sh -c "echo deb http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN//bin/linux/ubuntu precise/ >>/etc/apt/sources.list"

步骤2.

sudo apt-get update

步骤3.

sudo apt-get install r-base

4.可能遇到的问题

a.  W: GPG 错误：http://mirrors.ustc.edu.cn precise/ Release: 由于没有公钥，无法验证下列签名： NO_PUBKEY 51716619E084DAB9

解决：

下载密匙：
sudo apt-key adv --recv-keys --keyserver keyserver.ubuntu.com 51716619E084DAB9
导入密匙：
gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv E084DAB9
gpg --export --armor E084DAB9 | sudo apt-key add -

b.  W: GPG 错误：http://ppa.launchpad.net precise Release: 下列签名无效： BADSIG 84DBCE2DCEC45805 Launchpad PPA for Damien Cassou

这个错误比较麻烦，参考：

http://blog.csdn.net/jameshadoop/article/details/27810387

5.安装RStudio

下载：

http://www.rstudio.com/ide/download/desktop

RStudio 0.98.507 - Debian 6+/Ubuntu 10.04+ (32-bit)

sudo gdebi rstudio-0.98.507-i386.deb

如果提示没安装gdebi, 则 sudo apt-get install gdebi

6.安装RHive

配置环境变量：

export R_HOME=/usr/lib/R

创建 链接：
ln  -s   /usr/lib/R/bin/R  /usr/bin/R
运行命令：

R CMD javareconf JAVAH=/usr/local/java/jdk1.7.0_51/bin/javah JAR=/usr/local/java/jdk1.7.0_51/bin/jar

启动R ：

 sudo R

安装rJava：
install.packages("rJava")

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