并行计算

一、命令

（1）环境：改.bashrc:

指定intel 编译器的环境变量：
source /data/software/intel/compilers_and_libraries/linux/bin/compilervars.sh intel64
指定intel mpi 的环境变量：
source /data/software/intel/impi/5.1.3.210/bin64/mpivars.sh
指定intel mkl 库的环境变量：
source /data/software/intel/mkl/bin/mklvars.sh intel64

（2）编译：

mpiicc –o helloworld helloworld.c (先目标再源

（3）常用：

执行：qsub *.qsub

查看状态：qstat

取消：canceljob

（4）vim

在查找模式中加入\c表示大小写不敏感查找，\C表示大小写敏感查找。例如：

/foo\c ；n向后找，N向前

 

二、编程

（1）进程同步：信号量

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <mpi.h>
#include <fcntl.h>
#include <sys/stat.h>
#include <semaphore.h>

int main(int argc, char ** argv) {
FILE* fp;
long i, seqno = 1;
fp = fopen("seqno", "r+");
sem_t *sem = sem_open("/semlock", O_CREAT, 0644, 1); //打开信号量
for (i = 0; i < 20; i++) {
sem_wait(sem);//进入临界区
rewind(fp); /*rewind before read*/
fscanf(fp, "%ld\n", &seqno);
printf("pid = %d, seq# = %ld\n", getpid(), seqno);
seqno++;
rewind(fp); /*rewind before write*/
fprintf(fp, "%ld\n", seqno);
sem_post(sem);//出临界区
}
fclose(fp);
}

打开：有名信号量、内存信号量https://blog.csdn.net/maopig/article/details/52227768

详细教程：http://www.360doc.com/content/12/0419/10/54470_204839982.shtml

sem_open

　　文档http://man7.org/linux/man-pages/man3/sem_open.3.html#top_of_page

　　教程 https://blog.csdn.net/tennysonsky/article/details/46500417

　　　　由特定进程创建信号量，其他进程等待后打开

程序如果在还没有完成锁操作时退出，需要先重新初始化锁！（open的有名锁是跟内核走的）

 

（2）广播 已保证收到

 

（3）输出

　　多进程控制台输出有问题，需要上锁或指定进程号才有意义，否则控制台是乱的（各进程的单项输出也不连续，无可解释性） 

　　printf("%d",float)会出现迷之现象，位数解释不正确，并不能保留整数