作业lab1-1:lammps教程总结
一、总教程:
https://www.weibo.com/ttarticle/p/show?id=2313501000014189253469889617
(1)lammps很大,服务器网很慢。。。大概要40min才能下下来
(2)校园网有时候能上别的网站但连不上服务器(显示unreachable),重连一下校园网就好了。
(3)范例结果(还没有自己调参数):
二、待学习:
(1)configure的一套;
(2)编辑.bashrc,source .bashrc;
(3)tar解压命令
(4)安装各步都干了什么
比如最后跑例子的命令:【输入命令 mpirun -np 4 lmp_mpi < in.crack】:用法来源于lammps的官网:https://lammps.sandia.gov/doc/Run_basics.html
跟着教程做遇到的问题
(1)做make的时候,configure之后make报错:
make: *** No targets specified and no makefile found. Stop.
解决:应该是configure的prefix错了,要指定安装路径的绝对路径,可以用pwd看。之前我绝对路径写错了但是命令没有报错。正确的绝对路径打进去后会出现一堆check信息。
(2)tar lammps的报错:
[lxy@gpu8 lab1]$ tar -zxvf lammps-stable.tar.gz
gzip: stdin: unexpected end of file
lammps-22Aug18/
lammps-22Aug18/bench/
lammps-22Aug18/bench/log.6Oct16.rhodo.fixed.icc.4
lammps-22Aug18/bench/in.rhodo.scaled
lammps-22Aug18/bench/in.lj
lammps-22Aug18/bench/log.6Oct16.chain.scaled.icc.4
lammps-22Aug18/bench/in.chute
lammps-22Aug18/bench/log.6Oct16.chain.fixed.icc.1
lammps-22Aug18/bench/Cu_u3.eam
tar: Unexpected EOF in archive
tar: Unexpected EOF in archive
tar: Error is not recoverable: exiting now
解决:网上说tar的问题,再下一遍lammps。
linux中断下载不会删除已经下载了的文件,需要手删。
二、其他:
(1)查看发行版
https://www.cnblogs.com/wojiatingting/p/6879084.html
(2)按照官网的指导:要从EPEL库里面获得,但好像也不用?
安装EPEL库
也可以使用wget下载到本地然后用rpm安:https://www.cnblogs.com/lxz88/p/6278268.html
(2)无root安装rpm:
https://blog.csdn.net/feixiaohuijava/article/details/79152854