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[(http://catalog.mit.edu/degree-charts/computer-science-engineering-course-6-3/)] 阅读全文
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1.ls – Listls会列举出当前工作目录的内容（文件或文件夹），就跟你在GUI中打开一个文件夹去看里面的内容一样。2.mkdir – Make Directorymkdir <new-directory-name>常见一个新目录3.pwd – Print Working Directorypw 阅读全文
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来源https://baike.baidu.com/item/%E6%A3%80%E7%B4%A2%E8%A1%A8 定距式 这种形式也叫退格式检索表。在编排时每两个相对应的分支的开头，都编在离左端同等距离的地方，每一个分支的下面，相对应的两个分支的开头，比原分支向右移一个字格，这样编排下去，直到编 阅读全文
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函数nlminb()在实际应用中，上面这三个基本函数在遇到数据量较大或分布较复杂的计算时，就需要使用优化函数nlminb()nlminb(start, objective, gradient = NULL, hessian = NULL, ...,scale = 1, control = list( 阅读全文
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#in > rc_24[1:5,] X24h.B3.1 X24h.B3.2 X24h.D.1 X24h.D.2 B3-1000001 1298 1176 1347 2165 B3-1000002 602 593 560 1030 B3-1000003 272 286 296 432 B3-10000 阅读全文
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http://www.bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/DESeq2/inst/doc/DESeq2.html#time-series-experiments 阅读全文
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在测序数据中，我们经常能在差异统计表格看到P-value以及FDR值。而在生信数据的分析中，也会经常对P-value进行FDR校正。这么做的目的是什么，FDR校正的原理又是什么呢？首先我们来看 P-value的定义：在假设检验中，当原假设（H0）为真时，所得到的样本观察结果或更极端结果出现的概率。如 阅读全文
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在测序数据中，我们经常能在差异统计表格看到P-value以及FDR值。而在生信数据的分析中，也会经常对P-value进行FDR校正。这么做的目的是什么，FDR校正的原理又是什么呢？首先我们来看 P-value的定义：在假设检验中，当原假设（H0）为真时，所得到的样本观察结果或更极端结果出现的概率。如果P-value很小，说明原假设为真时，这个数据甚至更极端的数据出现的概率很小；而当P-value小... 阅读全文
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suppressPackageStartupMessages(library(ggpubr)) suppressPackageStartupMessages(library(ggplot2)) suppressPackageStartupMessages(library(ggrepel)) supp 阅读全文
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1）对每个基因进行p-value的计算 假设观测到基因A对应的reads数为x，已知在一个大文库中，每个基因的表达量只占所有基因表达量的一小部分，在这种情况下，p(x)的分布服从泊松分布。已知样本一中唯一比对到基因组的总reads数为N1，样本二中唯一比对到基因组的总reads数为N2，样本一中唯一 阅读全文