Dynamic Surface Proteomes of Allergenic Fungal Conidia(真菌分生孢子表面蛋白质组学)
文献名:Dynamic Surface Proteomes of Allergenic Fungal Conidia(真菌分生孢子表面蛋白质组学)
期刊名:Journal of Proteome Research
发表时间:2020年4月5日
原文链接(DOI):10.1021/acs.jproteome.0c00013
影响因子:3.78
单位:汉斯诺尔学院(德国),香港城市大学
物种:烟曲霉
样品类型:分生孢子
技术:表面蛋白质组
一、 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果)
本研究选取烟曲霉(Aspergillus fumigatus)分生孢子(conidia)的表面及分泌蛋白作为检测对象,利用LC-MS/MS平台进行曲霉表面蛋白质组学研究。测试了分生孢子两个不同阶段下(静息期和膨胀期),两种基因敲除株中以及不同温度下表面蛋白质组的变化。最终发现烟曲霉不同生长阶段下的表面蛋白质组具有显著差异,而基因敲除情况下蛋白质组变化不大。另外通过与其他真菌蛋白质进行比较,发现了42个仅在烟曲霉中表达的蛋白质。
二、 研究背景:(简要介绍研究进展动态、研究目的和意义)
真菌能够导致相关人类疾病的发生,烟曲霉能够感染人类肺部造成免疫疾病的发生。而真菌的分生孢子的定植作为真菌疾病的主要致病方式在该类疾病发生及防治中具有重要的地位。因此对于分生孢子表面蛋白质组的研究能够为由烟曲霉所造成的免疫疾病防治提供新的治疗靶点。
三、实验设计:
四、研究成果:(重点图表展示)
1、利用作者先前报道的方式对烟曲霉分生孢子的表面蛋白进行酶切。LC-MS/MS对烟曲霉的两种状态下样本进行检测。发现在两种测试菌株中与先前数据相比,其数据覆盖度较好。
2、对比烟曲霉四个不同时期及部位蛋白质组可以发现一些在不同部位或时期都有表达的蛋白,其中在四种阶段都能鉴定到的蛋白有35种,其中可以发现RodA蛋白丰度很高,这可能与某些分生孢子未能生长而导致累积有关。
3、选取两个参与SignalP信号通路的细胞壁蛋白CweA 和 ScwA,并构建者两种基因的敲除菌株。发现在表型上敲除菌株与野生型相比具有差异,然后对这两种菌株的分生孢子的表面蛋白组进行检测发现与野生型相比其在蛋白数量及表达上差异不大。
4、选取三个温度对烟曲霉分生孢子进行处理,然后对表面蛋白质组进行分析发现,37℃和42℃中的样本与室温相比其蛋白组没有显著性的差异。
5、为了找出烟曲霉感染肺部的特征蛋白质,因此与其他真菌的表面蛋白进行了比较,其中发现了42个只在烟曲霉表面蛋白组中独特表达的蛋白。
五、文章亮点(结论讨论):
通过蛋白质组学研究的方法研究了能够感染人肺部的真菌烟曲霉分生孢子的表面蛋白组,并探究了在不同发育时期及条件下其表面蛋白的差异。然后通过与其他真菌的比较筛选出独特的蛋白,这为相关的疾病的防治提供了新的蛋白靶点和策略。
阅读人:丑天胜