Mol Cell Proteomics. | Identification of salivary biomarkers for oral cancer detection with untargeted and targeted quantitative proteomics approaches (解读人：卜繁宇)
文献名：Identification of salivary biomarkers for oral cancer detection with untargeted and targeted quantitative proteomics approaches
期刊名：Molecular & Cellular Proteomics
发表时间：2019年9月
IF：4.828
单位：
- 台湾桃园长庚大学医学院
- 台湾桃园林口长庚纪念医院
- 台湾台中国立中兴大学
物种：人唾液
技术：非靶向和靶向组学组学
一、 概述：
本研究选取健康个体、口腔潜在恶性疾病（OPMD）患者及口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者的唾液，使用非靶向（iTRAQ-MS）对唾液蛋白质组进行定量分析。与非癌组（OPMD组和健康组）相比，OSCC组中67种蛋白质水平升高、18种蛋白质水平降低。使用多级反应监测（MRM-MS）进一步选择候选生物标志物并用免疫测定法验证，发现补体因子H（CFH）、纤维蛋白原α链（FGA）和α-1-抗胰蛋白酶（SERPINA1）可作为OSCC诊断的潜在唾液标志物。
二、 研究背景：
口腔鳞状细胞癌（OSCC）是世界上最常见的癌症之一。在台湾，OSCC是癌症相关死亡率的第五大原因，每年导致2800人死亡。超过50%的OSCC患者首次诊断时往往是晚期的，这迫切表明需要早期发现OSCC。本文选取唾液进行蛋白质组分析，旨在发现有潜力作为OSCC早期检测和/或预后的生物标志物。
三、实验设计：
四、研究成果：
1、整个实验过程可分为三个部分：非靶向质谱分析、靶向质谱验证和基于抗体的验证（图A），每个部分选取不同数量的唾液样本，特征如下表。
2、采用iTRAQ-MS对唾液蛋白质组进行分析，三次重复，分别鉴定出1838个蛋白质（图B）和定量了1705个蛋白质（图C）。
3、OSCC唾液蛋白质组差异表达分析。与健康对照组相比，OSCC组中有335个蛋白质过表达（图A）和312个蛋白质低表达（图C）。此外，与健康对照组相比，三次重复中共有147个差异表达蛋白，包括102个过表达和45个低表达；与OPMD对照组相比，三次重复均有173个差异表达蛋白，包括89个过表达和84个低表达。
4、与非癌组（OPMD组和健康组）相比，OSCC组中67种蛋白质水平升高、18种蛋白质水平降低，表明这些蛋白有可能成为OSCC诊断的标志物。在这些蛋白中添加稳定同位素标准肽（SIS）作为内部标准肽，进一步使用LC-MRM-MS方法筛选候选生物标志物。结果在67个蛋白中，24个蛋白在70分钟的LC-MRM-MS检测中被检测出来（如下表）。
与健康对照组相比，OSCC组中有6个蛋白显著过表达（APOA1、APOA4、CFH、FGA、SERPINA1和SERPIND1）。
5、使用sandwich ELISA在100名健康个体、55名OPMD患者和77名OSCC患者中进一步验证上述6个蛋白，发现OSCC组中CFH、FGA和SERPINA1蛋白水平显著高于健康对照组和OPMD对照组（图A）。通过ROC曲线分析进一步评价这三种蛋白的生物标志物（图B）。
五、文章亮点（结论讨论）：
使用非靶向iTRAQ-MS对健康个体、OPMD患者和OSCC患者的唾液样本进行定量分析，用MRM-MS和免疫测定法验证唾液生物标志物候选物，鉴定出CFH、FGA和SERPINA1蛋白可作为口腔癌的潜在生物标志物。
阅读人：卜繁宇
原文链接：https://www.mcponline.org/content/18/9/1796.abstract
DOI: https://doi.org/10.1074/mcp.RA119.001530
