hadoop 数据采样
http://www.cnblogs.com/xuxm2007/archive/2012/03/04/2379143.html 原文地址如上: 关于Hadoop中的采样器 1.为什么要使用采样器 在这个网页上有一段描述比较靠谱 http://www.philippeadjiman.com/blog/2009/12/20/hadoop-tutorial-series-issue-2-getting-started-with-customized-partitioning/ 简单的来说就是解决"How to automatically find “good” partitioning function",因为很多时候无法直接制订固定的partitioner策略,所以需要知道实际的数据分布.糟糕的策略导致的结果就是每个reduce节点得到的数据部均匀,对效率影响挺大 2.如何使用采样器 复制代码 conf.setPartitionerClass(TotalOrderPartitioner.class);//关于partitioner可以参考这个实现 使用采样器产生的文件 InputSampler.RandomSampler<IntWritable, NullWritable> sampler = new InputSampler.RandomSampler<IntWritable, NullWritable>(0.1,10000,10); Path partitionFile = new Path(input,”_partitions”); TotalOrderPartitioner.setPartitionFile(conf, partitionFile);//// InputSampler.writePartitionFile(conf, sampler); //一般都将该文件做distribute cache处理 URI partitionURI = new URI(partitionFile.toString() + “#_partitions”); DistributedCache.addCacheFile(partitionURI, conf); DistributedCache.createSymlink(conf); //从上面可以看出 采样器是在map阶段之前进行的 在提交job的client端完成的 复制代码 3.常用的采样器介绍 http://blog.csdn.net/andyelvis/article/details/7294811 Hadoop中采样是由org.apache.hadoop.mapred.lib.InputSampler类来实现的。 InputSampler类实现了三种采样方法:RandomSampler,SplitSampler和IntervalSampler。//RandomSampler最耗时 RandomSamplerSplitSampler、RandomSampler和IntervalSampler都是InputSampler的静态内部类,它们都实现了InputSampler的内部接口Sampler接口 public interface Sampler<K,V>{ K[] getSample(InputFormat<K,V> inf,JobConf job) throws IOException; } getSample方法根据job的配置信息以及输入格式获得抽样结果,三个采样类各自有不同的实现。 RandomSampler随机地从输入数据中抽取Key,是一个通用的采样器。RandomSampler类有三个属性:freq(一个Key被选中的概率),numSamples(从所有被选中的分区中获得的总共的样本数目),maxSplitsSampled(需要检查扫描的最大分区数目)。 RandomSampler中getSample方法的实现如下: 复制代码 public K[] getSample(InputFormat<K,V> inf, JobConf job) throws IOException { InputSplit[] splits = inf.getSplits(job, job.getNumMapTasks()); ArrayList<K> samples = new ArrayList<K>(numSamples); int splitsToSample = Math.min(maxSplitsSampled, splits.length); Random r = new Random(); long seed = r.nextLong(); r.setSeed(seed); LOG.debug("seed: " + seed); // shuffle splits for (int i = 0; i < splits.length; ++i) { InputSplit tmp = splits[i]; int j = r.nextInt(splits.length); splits[i] = splits[j]; splits[j] = tmp; } // our target rate is in terms of the maximum number of sample splits, // but we accept the possibility of sampling additional splits to hit // the target sample keyset for (int i = 0; i < splitsToSample || (i < splits.length && samples.size() < numSamples); ++i) { RecordReader<K,V> reader = inf.getRecordReader(splits[i], job, Reporter.NULL); K key = reader.createKey(); V value = reader.createValue(); while (reader.next(key, value)) { if (r.nextDouble() <= freq) { if (samples.size() < numSamples) { samples.add(key); } else { // When exceeding the maximum number of samples, replace a // random element with this one, then adjust the frequency // to reflect the possibility of existing elements being // pushed out int ind = r.nextInt(numSamples); if (ind != numSamples) { samples.set(ind, key); } freq *= (numSamples - 1) / (double) numSamples; } key = reader.createKey(); } } reader.close(); } return (K[])samples.toArray(); } 复制代码 首先通过InputFormat的getSplits方法得到所有的输入分区;然后确定需要抽样扫描的分区数目,取输入分区总数与用户输入的maxSplitsSampled两者的较小的值得到splitsToSample;然后对输入分区数组shuffle排序,打乱其原始顺序;然后循环逐个扫描每个分区中的记录进行采样,循环的条件是当前已经扫描的分区数小于splitsToSample或者当前已经扫描的分区数超过了splitsToSample但是小于输入分区总数并且当前的采样数小于最大采样数numSamples。 每个分区中记录采样的具体过程如下: 从指定分区中取出一条记录,判断得到的随机浮点数是否小于等于采样频率freq,如果大于则放弃这条记录,然后判断当前的采样数是否小于最大采样数,如果小于则这条记录被选中,被放进采样集合中,否则从【0,numSamples】中选择一个随机数,如果这个随机数不等于最大采样数numSamples,则用这条记录替换掉采样集合随机数对应位置的记录,同时采样频率freq减小变为freq*(numSamples-1)/numSamples。然后依次遍历分区中的其它记录。 SplitSampler从s个分区中采样前n个记录,是采样随机数据的一种简便方式。SplitSampler类有两个属性:numSamples(最大采样数),maxSplitsSampled(最大分区数)。其getSample方法实现如下: 复制代码 public K[] getSample(InputFormat<K,V> inf, JobConf job) throws IOException { InputSplit[] splits = inf.getSplits(job, job.getNumMapTasks()); ArrayList<K> samples = new ArrayList<K>(numSamples); int splitsToSample = Math.min(maxSplitsSampled, splits.length); int splitStep = splits.length / splitsToSample; int samplesPerSplit = numSamples / splitsToSample; long records = 0; for (int i = 0; i < splitsToSample; ++i) { RecordReader<K,V> reader = inf.getRecordReader(splits[i * splitStep], job, Reporter.NULL); K key = reader.createKey(); V value = reader.createValue(); while (reader.next(key, value)) { samples.add(key); key = reader.createKey(); ++records; if ((i+1) * samplesPerSplit <= records) { break; } } reader.close(); } return (K[])samples.toArray(); } 复制代码 首先根据InputFormat得到输入分区数组;然后确定需要采样的分区数splitsToSample为最大分区数和输入分区总数之间的较小值;然后确定对分区采样时的间隔splitStep为输入分区总数除splitsToSample的商;然后确定每个分区的采样数samplesPerSplit为最大采样数除splitsToSample的商。被采样的分区下标为i*splitStep,已经采样的分区数目达到splitsToSample即停止采样。 对于每一个分区,读取一条记录,将这条记录添加到样本集合中,如果当前样本数大于当前的采样分区所需要的样本数,则停止对这个分区的采样。如此循环遍历完这个分区的所有记录。 IntervalSampler根据一定的间隔从s个分区中采样数据,非常适合对排好序的数据采样。IntervalSampler类有两个属性:freq(哪一条记录被选中的概率),maxSplitsSampled(采样的最大分区数)。其getSample方法实现如下: 复制代码 public K[] getSample(InputFormat<K,V> inf, JobConf job) throws IOException { InputSplit[] splits = inf.getSplits(job, job.getNumMapTasks()); ArrayList<K> samples = new ArrayList<K>(); int splitsToSample = Math.min(maxSplitsSampled, splits.length); int splitStep = splits.length / splitsToSample; long records = 0; long kept = 0; for (int i = 0; i < splitsToSample; ++i) { RecordReader<K,V> reader = inf.getRecordReader(splits[i * splitStep], job, Reporter.NULL); K key = reader.createKey(); V value = reader.createValue(); while (reader.next(key, value)) { ++records; if ((double) kept / records < freq) { ++kept; samples.add(key); key = reader.createKey(); } } reader.close(); } return (K[])samples.toArray(); } 复制代码 首先根据InputFormat得到输入分区数组;然后确定需要采样的分区数splitsToSample为最大分区数和输入分区总数之间的较小值;然后确定对分区采样时的间隔splitStep为输入分区总数除splitsToSample的商。被采样的分区下标为i*splitStep,已经采样的分区数目达到splitsToSample即停止采样。 对于每一个分区,读取一条记录,如果当前样本数与已经读取的记录数的比值小于freq,则将这条记录添加到样本集合,否则读取下一条记录。这样依次循环遍历完这个分区的所有记录。 4.采样器在实际中的使用 常见的例子是terasort http://blog.csdn.net/scutshuxue/article/details/5915697 排序的基本思想是利用了mapreduce的自动排序功能,在hadoop中,从map到reduce阶段,map出来的结构会按照各个key按照hash值分配到各个reduce中,其中,在reduce中所有的key都是有序的了。如果使用一个reduce,那么我们直接将他output出来就行了,但是这不能够体现分布式的好处,所以,我们还是要用多个reduce来跑。 比方说我们有1000个1-10000的数据,跑10个ruduce任务, 如果我们运行进行partition的时候,能够将在1-1000中数据的分配到第一个reduce中,1001-2000的数据分配到第二个reduce中,以此类推。即第n个reduce所分配到的数据全部大于第n-1个reduce中的数据。这样,每个reduce出来之后都是有序的了,我们只要cat所有的输出文件,变成一个大的文件,就都是有序的了。 基本思路就是这样,但是现在有一个问题,就是数据的区间如何划分,在数据量大,还有我们并不清楚数据分布的情况下。一个比较简单的方法就是采样,假如有一亿的数据,我们可以对数据进行采样,如取10000个数据采样,然后对采样数据分区间。在Hadoop中,patition我们可以用TotalOrderPartitioner替换默认的分区。然后将采样的结果传给他,就可以实现我们想要的分区。在采样时,我们可以使用hadoop的几种采样工具,RandomSampler,InputSampler,IntervalSampler。
http://www.2cto.com/kf/201403/284174.html 用基于MapReduce的程序来处理TB级的数据集,要花费的时间可能是数以小时计。仅仅是优化代码是很难达到良好的效果。 在开发和调试代码的时候,没有必要处理整个数据集。但如果在这种情况下要保证数据集能够被正确地处理,就需要用到抽样了。抽样是统计学中的一个方法。它通过一定的过程从整个数据中抽取出一个子数据集。这个子数据集能够代表整体数据集的数据分布状况。在MapReduce中,开发人员可以只针对这个子数据集进行开发调试,极大减小了系统负担,提高了开发效率。 技术23 水塘抽样(Reservoir sampling) 假设如下场景:在开发一个MapReduce作业的时候,需要反复不断地去测试一个超大数据集。当然,处理这个数据集很费时间,想要快速开发几乎不可能。 问题 在开发MapReduce作业的时候,如何能够只用处理超大数据集的一个小小的子集? 方案 在读取数据的那部分,自定义一个InputFormat来封装默认的InputFormat。在自定义的InputFormat中,将从默认的InputFormat中得到的数据按一定比例进行抽样。 讨论 由于水塘抽样可以从数据流中随机采样,它就特别适合于MapReduce。在MapReduce中,数据源的形式就是数据流。图4.16说明了水塘抽样的算法。 这里需要实现ReservoirSamplerRecordReader类来封装默认的InputFormat类和RecordReader类。InputFormat类的作用是对输入进行分块。RecordReader类的作用是读取记录。抽样功能则在ReservoirSamplerRecordReader类中实现。图4.17说明了ReservoirSamplerRecordReader类的工作机制。 以下是ReservoirSamplerRecordReader类的实现代码: 复制代码 1 public static class ReservoirSamplerRecordReader<K extends Writable, V extends Writable> extends RecordReader { 2 3 private final RecordReader<K, V> rr; 4 private final int numSamples; 5 private final int maxRecords; 6 private final ArrayList<K> keys; 7 private final ArrayList<V> values; 8 9 @Override 10 public void initialize(InputSplit split,TaskAttemptContext context) 11 throws IOException, InterruptedException { 12 13 rr.initialize(split, context); 14 Random rand = new Random(); 15 16 for (int i = 0; i < maxRecords; i++) { 17 if (!rr.nextKeyValue()) { 18 break; 19 } 20 21 K key = rr.getCurrentKey(); 22 V val = rr.getCurrentValue(); 23 24 if (keys.size() < numSamples) { 25 keys.add(WritableUtils.clone(key, conf)); 26 values.add(WritableUtils.clone(val, conf)); 27 } else { 28 int r = rand.nextInt(i); 29 if (r < numSamples) { 30 keys.set(r, WritableUtils.clone(key, conf)); 31 values.set(r, WritableUtils.clone(val, conf)); 32 } 33 } 34 } 35 } 36 ... 复制代码 在使用ReservoirSamplerInputFormat类的时候,需要设置的参数包括InputFormat等。以下是设置代码: 1 ReservoirSamplerInputFormat.setInputFormat(job,TextInputFormat.class); 2 ReservoirSamplerInputFormat.setNumSamples(job, 10); 3 ReservoirSamplerInputFormat.setMaxRecordsToRead(job, 10000); 4 ReservoirSamplerInputFormat.setUseSamplesNumberPerInputSplit(job, true); 然后在batch中执行作业,输入文件是name.txt,有88799行。经过抽样后的文件只有10行了。以下是作业执行的过程: 复制代码 $ wc -l test-data/names.txt 88799 test-data/names.txt $ hadoop fs -put test-data/names.txt names.txt $ bin/run.sh com.manning.hip.ch4.sampler.SamplerJob \ names.txt output $ hadoop fs -cat output/part* | wc -l 10 复制代码 前面设置的ReservoirSamplerInputFormat类的参数是抽样10行,最后的结果就是10行。 小结 抽样可以把数据集的尺寸变小,这对开发是很有帮助的。如果有时需要抽样,有时不需要抽样,怎么才能把抽样功能很好地整合到代码库中呢?这里有个方法,在作业的configure中加入一个开关,如下面的代码所示: 复制代码 1 if(appConfig.isSampling()) { 2 ReservoirSamplerInputFormat.setInputFormat(job, 3 TextInputFormat.class); 4 ... 5 } else { 6 job.setInputFormatClass(TextInputFormat.class); 7 } 复制代码