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2018年11月18日 #

实战--利用SVM对基因表达标本是否癌变的预测

摘要: 利用支持向量机对基因表达标本是否癌变的预测 As we mentioned earlier, gene expression analysis has a wide variety of applications, including cancer studies. In 1999, Uri Alo 阅读全文

posted @ 2018-11-18 19:53 iojafekniewg 阅读(444) 评论(0) 推荐(0) 编辑

笔记 Bioinformatics Algorithms Chapter7

摘要: 一、Lloyd算法 二、Soft-Kmeans 聚类 Lloyd算法的缺点是对每个数据做出是或者非的决定;一种soft-kmean聚类方法对每个点属于哪一类,用一个评分体系来衡量 (1)条件概率 掷两个不知道bias的骰子,你要通过五组骰子掷出的结果来判断每次掷的是哪种骰子 五组实验,掷出 head 阅读全文

posted @ 2018-11-18 18:05 iojafekniewg 阅读(384) 评论(0) 推荐(0) 编辑

实战--利用HierarchicalClustering 进行基因表达聚类分析

摘要: 利用建立分级树对酵母基因表达数据进行聚类分析 一、原理 根据基因表达数据,得出距离矩阵 ↓ 最初,每个点都是一个集合 每次选取距离最小的两个集合,将他们合并,然后更新这个新集合与其它点的距离 新集合与别的集合距离的计算方法 ①两个集合之间的最短距离 ②两个集合所有点之间求距离求平均 → 把这个新集合 阅读全文

posted @ 2018-11-18 14:16 iojafekniewg 阅读(2128) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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