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11 2018 档案

【转】Map 与 Unordered_map
摘要:map和unordered_map的差别和使用 map和unordered_map的差别和使用 map和unordered_map的差别还不知道或者搞不清unordered_map和map是什么的,请见:http://blog.csdn.net/billcyj/article/details/780 阅读全文

posted @ 2018-11-30 19:24 iojafekniewg 阅读(215) 评论(0) 推荐(0)

Chapter7 抑癌基因
摘要:一、实验证明,如果肿瘤不是肿瘤病毒产生时,与正常细胞融合后,其恶性表型是隐形的 二、 家族性视网膜母细胞瘤的形成模型 如何使得一个细胞获得两个突变(两次随机的突变可能性太小) 模型一:有丝分裂的同源重组 近亲结婚容易发生有丝分裂同源重组,导致杂合性缺失 模型二:基因延长的时候聚合酶短暂地以同源染色体 阅读全文

posted @ 2018-11-28 22:06 iojafekniewg 阅读(895) 评论(0) 推荐(0)

总结 搜索和最短路径问题
摘要:DFS BFS Dijkstra Spfa Floyd 阅读全文

posted @ 2018-11-28 13:25 iojafekniewg 阅读(523) 评论(0) 推荐(0)

1131 Subway Map DFS解法 BFS回溯!
摘要:In the big cities, the subway systems always look so complex to the visitors. To give you some sense, the following figure shows the map of Beijing su 阅读全文

posted @ 2018-11-28 13:10 iojafekniewg 阅读(395) 评论(0) 推荐(0)

Chapter5 生长因子、受体和癌症
摘要:一、Src蛋白是一种蛋白激酶 可以磷酸化不同的底物,调节不同的通路 Src激酶主要磷酸化酪氨酸残基,而别的激酶主要磷酸化色氨酸、苏氨酸残基 二、EGF受体拥有酪氨酸激酶功能 胞内结构域有Src蛋白的同源区域,可以磷酸化某些蛋白质的酪氨酸 不少酪氨酸激酶都有整体上的相似性,许多具有癌蛋白样作用 各种不 阅读全文

posted @ 2018-11-26 21:39 iojafekniewg 阅读(1186) 评论(0) 推荐(0)

Chapter6 胞内信号网络
摘要:一、一条从细胞表面到细胞核的通路 二、Ras蛋白处于复杂信号级联的中心位置 胞外信号→酪氨酸激酶受体→Shc→Grb→Sos→Ras 三、酪氨酸的磷酸化控制着许多胞内信号蛋白的定位与活动 Src蛋白的同源结构域 SH1:催化 SH2:受体,识别特异的磷酸化多肽 还可以与一个伴侣蛋白相结合(一些酶) 阅读全文

posted @ 2018-11-26 21:39 iojafekniewg 阅读(822) 评论(0) 推荐(0)

【转】B树、B+树、B*树
摘要:出处:http://blog.csdn.net/v_JULY_v 1.前言: 动态查找树主要有:二叉查找树(Binary Search Tree),平衡二叉查找树(Balanced Binary Search Tree),红黑树(Red-Black Tree ),B-tree/B+-tree/ B* 阅读全文

posted @ 2018-11-25 18:51 iojafekniewg 阅读(185) 评论(0) 推荐(0)

1119 Pre- and Post-order Traversals
摘要:Suppose that all the keys in a binary tree are distinct positive integers. A unique binary tree can be determined by a given pair of postorder and ino 阅读全文

posted @ 2018-11-25 16:05 iojafekniewg 阅读(226) 评论(0) 推荐(0)

1018 Public Bike Management
摘要:There is a public bike service in Hangzhou City which provides great convenience to the tourists from all over the world. One may rent a bike at any s 阅读全文

posted @ 2018-11-25 14:57 iojafekniewg 阅读(229) 评论(0) 推荐(0)

1024 Palindromic Number int_string转换 大整数相加
摘要:A number that will be the same when it is written forwards or backwards is known as a Palindromic Number. For example, 1234321 is a palindromic number 阅读全文

posted @ 2018-11-24 18:52 iojafekniewg 阅读(273) 评论(0) 推荐(0)

1057 Stack 树状数组
摘要:Stack is one of the most fundamental data structures, which is based on the principle of Last In First Out (LIFO). The basic operations include Push ( 阅读全文

posted @ 2018-11-21 19:41 iojafekniewg 阅读(152) 评论(0) 推荐(0)

1045 Favorite Color Stripe 动态规划
摘要:1045 Favorite Color Stripe 1045. Favorite Color Stripe (30)Eva is trying to make her own color stripe out of a given one. She would like to keep only 阅读全文

posted @ 2018-11-21 10:45 iojafekniewg 阅读(285) 评论(0) 推荐(0)

实战--利用SVM对基因表达标本是否癌变的预测
摘要:利用支持向量机对基因表达标本是否癌变的预测 As we mentioned earlier, gene expression analysis has a wide variety of applications, including cancer studies. In 1999, Uri Alo 阅读全文

posted @ 2018-11-18 19:53 iojafekniewg 阅读(448) 评论(0) 推荐(0)

笔记 Bioinformatics Algorithms Chapter7
摘要:一、Lloyd算法 二、Soft-Kmeans 聚类 Lloyd算法的缺点是对每个数据做出是或者非的决定;一种soft-kmean聚类方法对每个点属于哪一类,用一个评分体系来衡量 (1)条件概率 掷两个不知道bias的骰子,你要通过五组骰子掷出的结果来判断每次掷的是哪种骰子 五组实验,掷出 head 阅读全文

posted @ 2018-11-18 18:05 iojafekniewg 阅读(424) 评论(0) 推荐(0)

实战--利用HierarchicalClustering 进行基因表达聚类分析
摘要:利用建立分级树对酵母基因表达数据进行聚类分析 一、原理 根据基因表达数据,得出距离矩阵 ↓ 最初,每个点都是一个集合 每次选取距离最小的两个集合,将他们合并,然后更新这个新集合与其它点的距离 新集合与别的集合距离的计算方法 ①两个集合之间的最短距离 ②两个集合所有点之间求距离求平均 → 把这个新集合 阅读全文

posted @ 2018-11-18 14:16 iojafekniewg 阅读(2186) 评论(0) 推荐(0)

脂类代谢与合成
摘要:脂肪的生物氧化 一、脂肪酸的活化 位于:线粒体基质 脂酰CoA合酶 利用焦磷酸的水解推动反应发生 二、脂肪酸转入线粒体 肉碱 肉碱脂酰移位酶I、II 三、β氧化 位置:线粒体基质 酶: 硫激酶 脂酰CoA脱氢酶 烯酰CoA水合酶 羟脂酰CoA脱氢酶 硫解酶 脱氢:加水加成:氧化成醛:CoA-SH进攻 阅读全文

posted @ 2018-11-17 10:35 iojafekniewg 阅读(4201) 评论(0) 推荐(0)

氧化磷酸化
摘要:恢复内容开始 一、丙酮酸转化为乙酰辅酶A 1、位置: 2、酶:丙酮酸脱氢酶复合体 (1)组成 丙酮酸脱氢酶 二氢硫辛酰转乙酰酶 二氢硫辛酰脱氢酶 其中,真核生物的丙酮酸脱氢酶复合体还结合着: 丙酮酸脱氢酶激酶 丙酮酸脱氢酶磷酸酶 通过磷酸化、去磷酸化分别抑制、激活活性 3、催化过程依次需要物种辅助因 阅读全文

posted @ 2018-11-17 09:36 iojafekniewg 阅读(3743) 评论(0) 推荐(1)

柠檬酸循环
摘要:一、丙酮酸转化为乙酰辅酶A 1、位置: 2、酶:丙酮酸脱氢酶复合体 (1)组成 丙酮酸脱氢酶 二氢硫辛酰转乙酰酶 二氢硫辛酰脱氢酶 其中,真核生物的丙酮酸脱氢酶复合体还结合着: 丙酮酸脱氢酶激酶 丙酮酸脱氢酶磷酸酶 通过磷酸化、去磷酸化分别抑制、激活活性 3、催化过程依次需要物种辅助因子 磷酸硫胺素 阅读全文

posted @ 2018-11-16 20:13 iojafekniewg 阅读(5866) 评论(0) 推荐(1)

1071 Speech Patterns
摘要:People often have a preference among synonyms of the same word. For example, some may prefer "the police", while others may prefer "the cops". Analyzi 阅读全文

posted @ 2018-11-16 08:50 iojafekniewg 阅读(294) 评论(0) 推荐(0)

Chapter15 Principles of Metabolic Regulation
摘要:15.1 调节代谢的通路 (1)细胞和有机体维持着动态稳定 调节作用的基因多 2500个 12% 激酶占比多 300个 一个通路受到多方调节 (2)酶的数量和催化活性 可以被调节 反应物的调控 糖酵解的产物,代谢物和cofactor,底物 信号分子的调控 cAMP,Ca2+ ①细胞外信号:激素、神经 阅读全文

posted @ 2018-11-13 22:10 iojafekniewg 阅读(651) 评论(0) 推荐(0)

1085. Perfect Sequence
摘要:Given a sequence of positive integers and another positive integer p. The sequence is said to be a “perfect sequence” if M <= m * p where M and m are 阅读全文

posted @ 2018-11-13 09:12 iojafekniewg 阅读(183) 评论(0) 推荐(0)

Chapter14 糖酵解 糖异生 戊糖途径
摘要:糖酵解 一、 1、总览 产生丙酮酸 产生两个ATP 产生两个NADH 产生丙酮酸 产生两个ATP 产生两个NADH 丙酮酸的去路: 产生乙醇 产生乳酸 乙酰辅酶A 参与其他合成 2、氧化磷酸化和之后的底物水平磷酸化是一个藕联过程 3、能量存在丙酮酸中 4、磷酸化中间体的重要意义 防止中间产物出胞 为 阅读全文

posted @ 2018-11-11 15:21 iojafekniewg 阅读(3221) 评论(0) 推荐(0)

1093 Count PAT's
摘要:The string APPAPT contains two PAT's as substrings. The first one is formed by the 2nd, the 4th, and the 6th characters, and the second one is formed 阅读全文

posted @ 2018-11-10 22:18 iojafekniewg 阅读(171) 评论(0) 推荐(0)

1098 Insertion or Heap Sort
摘要:According to Wikipedia: Insertion sort iterates, consuming one input element each repetition, and growing a sorted output list. Each iteration, insert 阅读全文

posted @ 2018-11-10 15:29 iojafekniewg 阅读(149) 评论(0) 推荐(0)

1101 Quick Sort
摘要:There is a classical process named partition in the famous quick sort algorithm. In this process we typically choose one element as the pivot. Then th 阅读全文

posted @ 2018-11-09 14:41 iojafekniewg 阅读(185) 评论(0) 推荐(0)

1105 Spiral Matrix
摘要:This time your job is to fill a sequence of N positive integers into a spiral matrix in non-increasing order. A spiral matrix is filled in from the fi 阅读全文

posted @ 2018-11-09 10:52 iojafekniewg 阅读(221) 评论(0) 推荐(0)

1111 Online Map (30 分)
摘要:1111. Online Map (30)Input our current position and a destination, an online map can recommend several paths. Now your job is to recommend two paths t 阅读全文

posted @ 2018-11-08 21:14 iojafekniewg 阅读(384) 评论(0) 推荐(0)

1109 Group Photo
摘要:Formation is very important when taking a group photo. Given the rules of forming K rows with N people as the following: The number of people in each 阅读全文

posted @ 2018-11-08 11:00 iojafekniewg 阅读(332) 评论(0) 推荐(0)

1114 Family Property
摘要:This time, you are supposed to help us collect the data for family-owned property. Given each person's family members, and the estate(房产)info under hi 阅读全文

posted @ 2018-11-07 20:11 iojafekniewg 阅读(341) 评论(0) 推荐(0)

N-Queens n皇后问题
摘要:八皇后问题:规则是皇后不能处于对角线,切皇后不能挨着递归回溯法 求八皇后问题解的个数 1 #include 2 #include 3 using namespace std; 4 const int maxn = 1003; 5 6 int n,sum = 0; 7 vector a; 8 9 bool isValid(int k,int i){ 10 bool ... 阅读全文

posted @ 2018-11-05 14:12 iojafekniewg 阅读(240) 评论(0) 推荐(0)

1129 Recommendation System
摘要:Recommendation system predicts the preference that a user would give to an item. Now you are asked to program a very simple recommendation system that 阅读全文

posted @ 2018-11-05 12:46 iojafekniewg 阅读(184) 评论(0) 推荐(0)

实战--利用Lloyd算法进行酵母基因表达数据的聚类分析
摘要:背景:酵母会在一定的时期发生diauxic shift,有一些基因的表达上升,有一些基因表达被抑制,通过聚类算法,将基因表达的变化模式聚成6类。 ORF Name R1.Ratio R2.Ratio R3.Ratio R4.Ratio R5.Ratio R6.Ratio R7.Ratio 1 YDR 阅读全文

posted @ 2018-11-04 12:37 iojafekniewg 阅读(1256) 评论(0) 推荐(0)

1143 Lowest Common Ancestor
摘要:The lowest common ancestor (LCA) of two nodes U and V in a tree is the deepest node that has both U and V as descendants. A binary search tree (BST) i 阅读全文

posted @ 2018-11-02 21:02 iojafekniewg 阅读(183) 评论(0) 推荐(0)

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