01 2022 档案

摘要:FASTQ with Emoji = FASTQE 🤔 表情版的FASTQC,适用于Illumina 1.8+/Sanger format 使用 安装 使用conda 或者pip pipinstallfastqe conda install -c bioconda fastqe 测试数 阅读全文
posted @ 2022-01-13 22:52 何物昂 阅读(156) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:SSH介绍 SSH(Secure Shell 的缩写)是一种网络协议,用于加密两台计算机之间的通信,并且支持各种身份验证机制。OpenSSH 工具是SSH 协议当前最流行的一种实现,Linux 的所有发行版几乎都自带 OpenSSH。 SSH 的软件架构是服务器-客户端模式(Server - Cli 阅读全文
posted @ 2022-01-06 14:20 何物昂 阅读(1320) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:Conda 简介 Conda 是一个开源的包管理系统和环境管理系统,可在 Windows、macOS 和 Linux 上运行。 Conda 可快速安装、运行和更新包及其依赖项。 Conda 可以轻松地在计算机上创建、保存、加载和切换环境。 它是为 Python 程序而创造的,但它可以打包和分发任何语 阅读全文
posted @ 2022-01-05 19:55 何物昂 阅读(3561) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:前言 pybedtools 是封装了BEDTools 所有可用的程序。下文学习下pybedtools 如何通过bed文件的坐标提取对应序列 正文 对pybedtools还不了解的参考下这篇文章 在Python中使用BEDTools。 提取序列的方法在BEDTools 中的命令是bedtools ge 阅读全文
posted @ 2022-01-04 13:29 何物昂 阅读(669) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:I have a Python, I have a BEDTools. Ah,pybedtools! 前言 pybedtools 是采用 Python 对BEDTools 软件的封装和扩展。为啥要用pybedtools ,而不是直接使用BEDTools 呢? 当然是我们想在Python 使用 BED 阅读全文
posted @ 2022-01-03 16:46 何物昂 阅读(3009) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:安装 安装软件 pip install dna_features_viewer -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple 代码 from dna_features_viewer import GraphicFeature, GraphicRecord s 阅读全文
posted @ 2022-01-01 20:53 何物昂 阅读(260) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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