学习笔记265—磁共振成像(MRI)入门——优质MRI在线学习视频、网站、书籍教材汇总
磁共振成像(MRI)入门——优质MRI在线学习视频、网站、书籍教材汇总
一、MRI在线视频教程
1. 台湾國立陽明大學卢家锋教授的静息态fMRI技术分析视频教程
详细讲解了静息态fMRI数据处理的方方面面,B站地址:静息态功能性磁振影像分析操作
2. Coursera网站上的MRI课程
包括MRI的基础、fMRI的数据处理等课程。官方网址:[https://www.coursera.org/learn/functional-mri-2#instructors]
3. fMRI数据分析:从MRI理论讲解到SPM操作
B站地址:[fMRI数据分析:从MRI理论讲解到SPM操作_哔哩哔哩_bilibili]
4. The R-fMRI Course V3.0 中文版(DPABI/DPARSF课程)
严超赣老师讲解的DPABI软件使用视频,B站地址:[视频去哪了呢?_哔哩哔哩_bilibili]
5. 从零开始学习MRI
偏重于MRI的临床应用技术,B站地址:[MRI从零开始学习MRI_哔哩哔哩_bilibili]
6.MRI技术系列讲座
由杨正汉老师主讲,偏重MRI成像技术、成像序列以及临床应用。爱奇艺地址:[热门影视_明星点评-爱奇艺]
MRI在线学习网站
1.静息态fMRI论坛
本论坛由杭州师大臧玉峰(ZANGYu-Feng )老师建立,主要讨论的是静息态fMRI的相关内容。网址:[Forum of resting-state fMRI]
2. The R-fMRI Network
本论坛由中科院心理所严超赣老师建立,主要分享静息态fMRI脑网络的学习资料以及软件DPABI的使用及答疑。网址:[http://www.rfmri.org/]
3. FMRI 4 NEWBIES
该网站由乔迪·库勒姆(Jody Culham) 在2000年代初创建,旨在提供资源,以教授功能性磁共振成像的实验设计和分析。网址:[Lectures — fMRI 4 Newbies]
4.SPM官网
除了SPM软件的使用,也是一个很好的MRI学习网站。网站:[https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/]
5.FSL官网
FSL(FMRIB-Software-Library)是由牛津大学功能脑成像中心(FMRIB)开发的一款可以用于分析磁共振脑图像的主流开源分析软件,目前世界范围内有超过1000个实验室使用该软件进行影像数据分析。用户可以通过FSL的英文官方网站下载软件,学习软件的安装和使用,并能够在线上论坛与软件开发者及广大使用者进行疑难解答和技术交流。网址:[FSL - FslWiki]
6.西南大学雷旭老师的博客以及实验室网站
记录了EEG、fMRI的相关学习内容。博客网址:[eegfmri_新浪博客]
实验室网址:[Sleep and NeuroImaging Center]
7. Neuroimaging Analysis within R
利用R语言进行MRI的分析教程。网址:[Neuroimaging Analysis within R]
8. 崔旭老师博客
写了很多关于脑电、fMRI、近红外等脑科学相关领域的知识,也可以帮助大家了解学术前沿动态。网址:[https://alivelearn.net/]
9. 台湾國立陽明大學卢家锋教授实验室网站
这里分享了很多关于fMRI、fNIRS、Matlab等相关学习资料。网址:[盧家鋒Chia-Feng Lu's NBA Lab]
MRI书籍教材
1.Handbook of functional MRI Data Analysis
这本手册是美国著名的Russell A. Poldrack教授所著,他是美国著名的心理学家和神经学家。目前是斯坦福大学的心理学教授,斯坦福神经科学研究所成员和斯坦福再生神经科学中心主任。这本书可以说是功能磁共振的入门级读物了,在这本书的开始详略得当的介绍了磁共振技术的发展和基本原理。其后是针对核磁数据处理分析的步骤进行详细的解释,同时介绍了不同的数据分析软件(以SPM和FSL为主)对于功能磁共振数据预处理的理解,解释了如头动处理、图像配准以及时间层矫正等多个预处理阶段遇到的问题,以及对该如何进行选择提供了一些建议。并且,在书的最后介绍了一些新出现的核磁数据处理方法(相对新,因为本书出版时,这些技术还应用不久),如独立成立分析、基于体素水平的MVPA方法等。这本书目前国内有翻译本,由马园林,张辉,陈峰翻译,翻译本基本还原了原著,读起来也不晦涩,是初次了解功能磁共振数据及其处理的上佳选择。
2.核磁共振原理及实验方法(高汉宾 张振芳)
这本书由中科院武汉物理与数学研究所的高级研究员张振芳和高汉宾主编,作为中文撰写的核磁共振类的数据可以作为一本入门读物。这本书的前五章介绍了基础的核磁知识,由于是由物理研究所撰写的,这本书更加偏向于核磁的成像原理、成像序列、核磁共振谱仪等方面,对于脑磁数据来说不是非常相关。但是这本书中综合了使用核磁技术的实验方法,在书中有一些相应的实验设计案例以及讲解,有助于了解核磁实验设计的基本知识。在书的后几章节,还分析了84个脉冲序列,可以说是核磁操作员的心头之物了
3. Introduction to Diffusion Tensor Imaging
DTI技术作为重要的脑结构成像技术,自出现以后就受到众多的关注。尽管在初期由于受到理论上存在缺陷的影响,被有所诟病。但是随着弥散张量成像技术的发展,DKI、HARDI等扫描序列的出现极大地提高了白质结构成像的稳定性和准确性。这本书是Susumu Mori and J-Donald Tournier教授共同撰写的,Susumu Mori是约翰霍普金斯大学放射科和放射科学系MRI研究部门的教授,他与其他学者合著了约140种参考出版物,为若干国家卫生研究所资助的校外项目担任主要研究员,并参与了许多脑科学方面的项目。这本书第二版,第一版相比于这一版少了很多新出现的弥散张量成像技术。这本书中使用了大量的插图来对难以理解的弥散张量成像技术进行有效的解读,以帮助读者更直观地理解这些技术的内部工作原理。书的重点放在解释DTI图像,实验的设计,以及可以进行的应用研究的类型。扩散MRI是一个非常活跃的研究领域,其理论和技术也还在不断发展的过程中。因此这本书是对之前发展的一个良好的总结。同时这本书适合DTI入门读者以及高阶修习者,是DTI数据理解的最佳选择。但这本书目前国内也没有翻译版本,原文也稍微有些阅读难度,建议有一定基础的读者选择阅读。不过大量的图片示例性解释相信会帮你不少。
4. An Introduction to Resting State fMRI Functional Connectivity
做静息态fMRI研究不得不读的一本书,较为全面地介绍了静息态fMRI数据处理的方方面面。
参考链接:https://zhuanlan.zhihu.com/p/463964060