学习笔记253—fmri_2 dicom转档

还是bilibili课程笔记 https://b23.tv/FvgWGP
P6 dicom转档与pre
1 看原始数据
1）软件 radiAnt
https://www.radiantviewer.com/c/how-to-install-radiant-dicom-viewer-on-macos/
这是软件官网，里面有一个安装教程，跟着安装顺序下需要的软件并安装
注：这个软件有个激活license的界面，直接点next可以先用软件，网上有教程说过期了重安
2）看数据，怎么看，包括哪些内容
视频讲的很清楚 在p6 8min左右

2 数据转换
目的：把source data 转换成SPM可以分析的数据（analysis data）
这是第二步数据转换了，上一个笔记里已经有一步数据转换了，将.IMA转成.dcm，链接如下：
https://editor.csdn.net/md/?articleId=109509832
整体类似：raw data —— source data —— analysis data 【个人理解，敬请指正】
所需软件 MRIConvert

（也有教用MRIcro这个软件转的，但是听完感觉比MRIConvert 复杂，略，感兴趣可以看p6 40min左右）
MRIConvert 软件网址：按电脑系统下载安装
https://lcni.uoregon.edu/downloads/mriconvert

直接点击.app 就能打开，不用把.pkg拉到applications

   1、 软件打开后，窗口上半部分，选择数据文件（输入），中间可以选择转成什么格式，拉开如下，选择 Analyze 7.5

2、 analysis 7.5 —— options （按需勾选）

3、选择folder——选择输出路径——convert all

数据转换结果—— analysis format
每个文件夹含三类文件
1、txt 是一些核磁相关的基础信息，写文章可以用到，比如trial number，number of slices
2、.hdr和.img都是成对的，hdr是对应的img的一些参数信息，往往比较小1k（必须要成对处理，比如删都删）
注：img和nifti两种格式，都可以用于spm分析，只是转换类型方式不一样。
IMG的来源是用MRIconvert软件里选择Analyze 7.5转出来的
nifti的来源是用MRIconvert软件里选择nifti转出来的

参考链接：https://blog.csdn.net/weixin_44669441/article/details/109718580