摘要: hippo信号通路 https://mp.weixin.qq.com/s/235HfZGjLlM_Wh2xpvEhng 美国德克萨斯大学西南医学中心的潘多加教授实验室率先在果蝇里鉴定出Hippo信号通路【1-4】,并发现Hippo信号通路主要通过转录共激活因子YAP/TAZ来控制组织生长【2,3】。 阅读全文
posted @ 2022-07-15 08:48 HANBUSHI 阅读(256) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: RNA-seq分析使用转录本水平还是基因组水平用于下游分析? 2022.7.11 该图片显示,使用基因组水平即可;与同学探究,二者对下游的分析是有影响的,但影响不大,且不清楚影响是正向的,还是反向的。所以还是决定用基因组水平。 阅读全文
posted @ 2022-07-11 10:00 HANBUSHI 阅读(88) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 作图 circlize:画圈圈图 ggpattern ggpubr:以ggplot2为基础,提供一些图的函数。参考:知乎 https://zhuanlan.zhihu.com/p/102653888 官网 http://rpkgs.datanovia.com/ggpubr/reference/ind 阅读全文
posted @ 2022-07-06 13:27 HANBUSHI 阅读(716) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 循环 while 循环处理文件夹下系列文本,并更改名字。一下以将bed文件转为bw文件为示例。 hg18_chrom_bed="genome.fa.fai" find . -maxdepth 1 -name '*.bed' -user "$USER" | while IFS='' read -r i 阅读全文
posted @ 2022-06-30 20:49 HANBUSHI 阅读(548) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 大致步骤 传代 293T为例 试剂准备:胰酶,全培养基,$ddH_2O$,放置在水浴锅$37^。$。 在无菌dish内加入适量(5ml)培养基,做好标签(细胞系,传代数,时间),以作后续使用。 从培养箱中取出细胞,用枪吸除培养基,再加入$ddH_2O$清洗一次,尽可能去除死细胞。 加入适量(1ml) 阅读全文
posted @ 2022-06-28 21:07 HANBUSHI 阅读(614) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: bcftools 按样本将vcf文件分割过程,没有把不在样本中突变位点移除。 阅读全文
posted @ 2022-06-27 16:37 HANBUSHI 阅读(70) 评论(0) 推荐(0) 编辑