MPI运行程序（接触）

 

网友遇到的问题并解决问题：mpich2在多个节点上运行并行程序时出错

我使用mpich2时遇到一下问题：
当我运行一个计算圆周率的并行程序cpi.c时，我想在指定的若干个节点上运行这个程序，比如host1，host2，host3等，于是我将这3个节点名称写在一个文件hostfile里，
以下是运行过程：
mpd &
mpicc cpi.c   //此时生成一个名为a.out的可执行文件
mpiexec -machinefile hostfile -n 3 ./a.out
就在此时出现了问题：
mpiexec: unable to start all procs; may have invalid machine names
    remaining specified hosts:
        IP地址 (host2)
 IP地址 (host3)

原因是这几个节点上的mpd连接不上从而无法通信，这个可能是ssh或是rsh的问题造成的。

但是这个问题可以通过手动执行以下命令来解决：（假设是在host1上编译这个并行程序，就在host1上执行以下命令）

mpd &
mpdtrace -l //此处列出主机名和端口号，形式为：<hostname>_<port>

然后登陆到文件中的其他每个节点执行以下命令：（此处为host2和host3）

mpd -h <hostname> -p <port> &   //这里hostname和port是host1的hostname和port。

然后在host1上执行mpdtrace就可以查看到执行mpd的主机名了，从而节点间也就可以正常痛心了。

再执行mpiexec -machinefile hostfile -n 3 ./a.out时，就可以看到所预期的结果了 o(∩_∩)o...

不过我感觉这个方法，不是最终的解决方法。还有待进一步研究。

 

转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_4fd6fd310100aimr.html