Graph database_neo4j 底层存储结构分析(5)

3.5 Property 的存储

下面是neo4j graph db 中，Property数据存储对应的文件：

neostore.propertystore.db

neostore.propertystore.db.arrays

neostore.propertystore.db.arrays.id

neostore.propertystore.db.id

neostore.propertystore.db.index

neostore.propertystore.db.index.id

neostore.propertystore.db.index.keys

neostore.propertystore.db.index.keys.id

neostore.propertystore.db.strings

neostore.propertystore.db.strings.id

neo4j 中, Property 的存储是由 PropertyStore, ArrayPropertyStore, StringPropertyStore 和PropertyKeyTokenStore 4种类型的Store配合来完成的.

类PropertyStore对应的存储文件是neostore.propertystore.db, 相应的用来存储 string/array 类型属性值的文件分别是neostore.propertystore.db.strings (StringPropertyStore) 和 neostore.propertystore.db.arrays(ArrayPropertyStore). 其存储模型示意图如下：

neo4j_存储模型_property_2--20140423

其中PropertyStore是Property最主要的存储结构，当Property的Key-Value对的Value 是字符串或数组类型并且要求的存储空间比较大，在PropertyStore中保存不了，则会存在StringPropertyStore/ ArrayPropertyStore这样的DynamicStore 中。如果长度超过一个block ，则分block存储，并将其在StringPropertyStore/ ArrayPropertyStore中的第1个block 的 block_id 保存到 PropertyStore类型文件相应record 的PropertyBlock字段中。

 PropertyKeyTokenStore和StringPropertyStore 配合用来存储Propery的Key部分。Propery的Key是编码的，key 的 id 保存在 PropertyKeyTokenStore (即 neostore.propertystore.db.index)，key 的字符串名保存在对应的StringPropertyStore类型文件neostore.propertystore.db.index.keys 中。

ArrayPropertyStore的存储格式见< 3.3.2 DynamicStore 类型>，下面分别介绍一下PropertyStore和PropertyKeyTokenStore（PropertyKeyTokenStore）的文件存储格式。

3.5.1   PropertyStore类型的存储格式

neostore.propertystore.db文件存储格式示意图如下，整个文件是有一个 RECORD_SIZE=41 Bytes 的定长数组和一个字符串描述符“PropertyStore v0.A.2”(文件类型描述TYPE_DESCRIPTOR和 neo4j 的 ALL_STORES_VERSION构成)。访问时，可以通过 prop_id 作为数组的下标进行访问。

neo4j_文件存储格式_PropertyStore--20140408

下面介绍一下 property record 中每个字段的含义：

  • highByte(1 Byte):第1字节,共分成2部分

/*

* [pppp,nnnn] previous, next high bits

*/

byte modifiers = buffer.get();

    1. 第1~4 bit 表示 next 的高4位；
    2. 第 5~8 bit表示 prev 的高4位
  • prev(4 Bytes) : Node或Relationship 的属性是通过双向链表方式组织的，prev 表示本属性在双向链表中的上一个属性的id。第2~5字节是prev property_id的 低32位. 加上highByte字节的第 5~8 bit作为高4位，构成一个完整的36位property_id。
  • next(4 Bytes) : next 表示本属性在双向链表中的下一个属性的id。第6~9字节是next property_id的 低32位. 加上highByte字节的第 1~4 bit作为高4位，构成一个完整的36位property_id。
  • payload:  payload 由block_header(8 Bytes)加3个property_block(8 Bytes)组成，共计 32 Bytes.  block_header 分成3部分:
    1. key_id(24 bits) : 第1 ~24 bit , property 的key 的 id
    2.  type( 4 bits ):   第25 ~28 bit , property 的 value 的类型，支持 string, Interger,Boolean, Float, Long,Double, Byte, Character,Short, array.
    3. payload(36 bits): 第29 ~64 bit, 共计36bit；对于Interger, Boolean, Float, Byte, Character , Short 类型的值，直接保存在payload；对于long，如果36位可以表示，则直接保存在payload，如果不够，则保存到第1个PropertyBlock中；double 类型，保存到第1个PropertyBlock中；对于 array/string ，如果编码后在 block_header及3个PropertyBlock 能保存，则直接保存；否则，保存到ArrayDynamicStore/StringDynamicStore 中， payload 保存其在ArrayDynamicStore中的数组下表。

3.5.2   String 类型属性值的保存过程

下面的代码片段展示了neo4j 中，比较长的 String 类型属性值的保存处理过程，其是如何分成多个 DynamicBlock 来存储的。

PropertyStore_encode

3.5.2.1        encodeValue 函数

encodeValue 函数是 PropertySTore.java 的成员函数, 它实现了不同类型的属性值的编码.

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</pre>
<div>
public void encodeValue( PropertyBlock block, int keyId, Object value )
 
{
 
if ( value instanceof String )
 
{   // Try short string first, i.e. inlined in the property block
 
String string = (String) value;
 
if ( LongerShortString.encode( keyId, string, block, PropertyType.getPayloadSize() ) )
 
{
 
return;
 
}
 
// Fall back to dynamic string store
 
byte[] encodedString = encodeString( string );
 
Collection valueRecords = allocateStringRecords( encodedString );
 
setSingleBlockValue( block, keyId, PropertyType.STRING, first( valueRecords ).getId() );
 
for ( DynamicRecord valueRecord : valueRecords )
 
{
 
valueRecord.setType( PropertyType.STRING.intValue() );
 
block.addValueRecord( valueRecord );
 
}
 
}
 
else if ( value instanceof Integer )
 
{
 
setSingleBlockValue( block, keyId, PropertyType.INT, ((Integer) value).longValue() );
 
}
 
else if ( value instanceof Boolean )
 
{
 
setSingleBlockValue( block, keyId, PropertyType.BOOL, ((Boolean) value ? 1L : 0L) );
 
}
 
else if ( value instanceof Float )
 
{
 
setSingleBlockValue( block, keyId, PropertyType.FLOAT, Float.floatToRawIntBits( (Float) value ) );
 
}
 
else if ( value instanceof Long )
 
{
 
long keyAndType = keyId | (((long) PropertyType.LONG.intValue()) << 24);
 
if ( ShortArray.LONG.getRequiredBits( (Long) value ) <= 35 )
 
{   // We only need one block for this value, special layout compared to, say, an integer
 
block.setSingleBlock( keyAndType | (1L << 28) | ((Long) value << 29) );
 
}
 
else
 
{   // We need two blocks for this value
 
block.setValueBlocks( new long[]{keyAndType, (Long) value} );
 
}
 
}
 
else if ( value instanceof Double )
 
{
 
block.setValueBlocks( new long[]{
 
keyId | (((long) PropertyType.DOUBLE.intValue()) << 24),
 
Double.doubleToRawLongBits( (Double) value )} );
 
}
 
else if ( value instanceof Byte )
 
{
 
setSingleBlockValue( block, keyId, PropertyType.BYTE, ((Byte) value).longValue() );
 
}
 
else if ( value instanceof Character )
 
{
 
setSingleBlockValue( block, keyId, PropertyType.CHAR, (Character) value );
 
}
 
else if ( value instanceof Short )
 
{
 
setSingleBlockValue( block, keyId, PropertyType.SHORT, ((Short) value).longValue() );
 
}
 
else if ( value.getClass().isArray() )
 
{   // Try short array first, i.e. inlined in the property block
 
if ( ShortArray.encode( keyId, value, block, PropertyType.getPayloadSize() ) )
 
{
 
return;
 
}
 
// Fall back to dynamic array store
 
Collection arrayRecords = allocateArrayRecords( value );
 
setSingleBlockValue( block, keyId, PropertyType.ARRAY, first( arrayRecords ).getId() );
 
for ( DynamicRecord valueRecord : arrayRecords )
 
{
 
valueRecord.setType( PropertyType.ARRAY.intValue() );
 
block.addValueRecord( valueRecord );
 
}
 
}
 
else
 
{
 
throw new IllegalArgumentException( "Unknown property type on: " + value + ", " + value.getClass() );
 
}
 
}

3.5.2.2        allocateStringRecords 函数

allocateStringRecords 函数是 PropertySTore.java 的成员函数.

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</pre>
<div>
private Collection allocateStringRecords( byte[] chars )
 
{
 
return stringPropertyStore.allocateRecordsFromBytes( chars );
 
}

3.5.2.3        allocateRecordsFromBytes 函数

allocateRecordsFromBytes 函数是 AbstractDynamicStore .java 的成员函数.

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</pre>
<div>
protected Collection allocateRecordsFromBytes( byte src[] )
 
{
 
return allocateRecordsFromBytes( src, Collections.emptyList().iterator(),
 
recordAllocator );
 
}

3.5.2.4        allocateRecordsFromBytes 函数

allocateRecordsFromBytes 函数是 AbstractDynamicStore .java 的成员函数.

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<div>
public static Collection allocateRecordsFromBytes(
 
byte src[], Iterator recordsToUseFirst,
 
DynamicRecordAllocator dynamicRecordAllocator )
 
{
 
assert src != null : "Null src argument";
 
List recordList = new LinkedList<>();
 
DynamicRecord nextRecord = dynamicRecordAllocator.nextUsedRecordOrNew( recordsToUseFirst );
 
int srcOffset = 0;
 
int dataSize = dynamicRecordAllocator.dataSize();
 
do
 
{
 
DynamicRecord record = nextRecord;
 
record.setStartRecord( srcOffset == 0 );
 
if ( src.length - srcOffset > dataSize )
 
{
 
byte data[] = new byte[dataSize];
 
System.arraycopy( src, srcOffset, data, 0, dataSize );
 
record.setData( data );
 
nextRecord = dynamicRecordAllocator.nextUsedRecordOrNew( recordsToUseFirst );
 
record.setNextBlock( nextRecord.getId() );
 
srcOffset += dataSize;
 
}
 
else
 
{
 
byte data[] = new byte[src.length - srcOffset];
 
System.arraycopy( src, srcOffset, data, 0, data.length );
 
record.setData( data );
 
nextRecord = null;
 
record.setNextBlock( Record.NO_NEXT_BLOCK.intValue() );
 
}
 
recordList.add( record );
 
assert !record.isLight();
 
assert record.getData() != null;
 
}
 
while ( nextRecord != null );
 
return recordList;
 
}

3.5.3   ShortArray 类型属性值的保存过程

ShortArray.encode( keyId, value, block, PropertyType.getPayloadSize() ), 它是在 kernel/impl/nioneo/store/ShortArray.java 中实现的，下面是其代码片段。

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public static boolean encode( int keyId, Object array, PropertyBlock target, int payloadSizeInBytes )
 
{
 
/*
 
*  If the array is huge, we don't have to check anything else.
 
*  So do the length check first.
 
*/
 
int arrayLength = Array.getLength( array );
 
if ( arrayLength > 63 )/*because we only use 6 bits for length*/
 
{
 
return false;
 
}
 
ShortArray type = typeOf( array );
 
if ( type == null )
 
{
 
return false;
 
}
 
int requiredBits = type.calculateRequiredBitsForArray( array, arrayLength );
 
if ( !willFit( requiredBits, arrayLength, payloadSizeInBytes ) )
 
{
 
// Too big array
 
return false;
 
}
 
final int numberOfBytes = calculateNumberOfBlocksUsed( arrayLength, requiredBits ) * 8;
 
if ( Bits.requiredLongs( numberOfBytes ) > PropertyType.getPayloadSizeLongs() )
 
{
 
return false;
 
}
 
Bits result = Bits.bits( numberOfBytes );
 
// [][][    ,bbbb][bbll,llll][yyyy,tttt][kkkk,kkkk][kkkk,kkkk][kkkk,kkkk]
 
writeHeader( keyId, type, arrayLength, requiredBits, result );
 
type.writeAll( array, arrayLength, requiredBits, result );
 
target.setValueBlocks( result.getLongs() );
 
return true;
 
}
 
private static void writeHeader( int keyId, ShortArray type, int arrayLength, int requiredBits, Bits result )
 
{
 
result.put( keyId, 24 );
 
result.put( PropertyType.SHORT_ARRAY.intValue(), 4 );
 
result.put( type.type.intValue(), 4 );
 
result.put( arrayLength, 6 );
 
result.put( requiredBits, 6 );
 
}

3.5.4   PropertyKeyTokenStore的文件存储格式

neo4j_文件存储格式_PropertyIndexStore--20140410

类PropertyTypeTokenStore对应的存储文件名是neostore.propertystore.db.index，其对应的存储格式如上图所示: 是一个长度为 RECORD_SIZE=9Bytes 的 record 数组和和一个字符串“PropertyIndexStore v0.A.2”(文件类型描述TYPE_DESCRIPTOR和 neo4j 的 ALL_STORES_VERSION构成)。访问时，可以通过 token_id 作为数组的下标进行访问。

record 是由 in_use(1 Byte) ,prop_count(4 Bytes), name_id(4 Bytes)构成。

posted @ 2015-06-02 10:41  GisClub  阅读(513)  评论(0)  编辑  收藏  举报