Spark 1.4.1中Beeline使用的gc overhead limit exceeded
最近使用SparkSQL做数据的打平操作,就是把多个表的数据经过关联操作导入到一个表中,这样数据查询的过程中就不需要在多个表中查询了,在数据量大的情况下,这样大大提高了查询效率。
我启动了thriftserver,然后通过beeline去连接thriftserver, 打平操作进行的很顺利,但是在执行groupby操作的时候beeline报了一个错误:gc overhead limit exceeded
我分析可能是thriftserver报的错误。但是查看了thriftserver的日志没有任何异常打出来,没办法重新执行该sql ,通过jmap跟了下,JVM的old区一直没有满,那就是不是thriftserver的问题了。
那么可能就是beeline的问题了,jmap跟了一下 ,beeline只有512m的内存,old区满满的。
下面就可以着手调整beeline的参数设置,我调整了java_opts, spark_daemon_memory,spark_driver_memory, spark_java_opts.统统不行,看了1.4.1的源码。是程序的问题,
幸好在spark 1.5中fix这个问题了。
查看SparkClassCommandBuilder的源码
if (className.equals("org.apache.spark.deploy.master.Master")) { javaOptsKeys.add("SPARK_DAEMON_JAVA_OPTS"); javaOptsKeys.add("SPARK_MASTER_OPTS"); memKey = "SPARK_DAEMON_MEMORY"; } else if (className.equals("org.apache.spark.deploy.worker.Worker")) { javaOptsKeys.add("SPARK_DAEMON_JAVA_OPTS"); javaOptsKeys.add("SPARK_WORKER_OPTS"); memKey = "SPARK_DAEMON_MEMORY"; } else if (className.equals("org.apache.spark.deploy.history.HistoryServer")) { javaOptsKeys.add("SPARK_DAEMON_JAVA_OPTS"); javaOptsKeys.add("SPARK_HISTORY_OPTS"); memKey = "SPARK_DAEMON_MEMORY"; } else if (className.equals("org.apache.spark.executor.CoarseGrainedExecutorBackend")) { javaOptsKeys.add("SPARK_JAVA_OPTS"); javaOptsKeys.add("SPARK_EXECUTOR_OPTS"); memKey = "SPARK_EXECUTOR_MEMORY"; } else if (className.equals("org.apache.spark.executor.MesosExecutorBackend")) { javaOptsKeys.add("SPARK_EXECUTOR_OPTS"); memKey = "SPARK_EXECUTOR_MEMORY"; } else if (className.equals("org.apache.spark.deploy.ExternalShuffleService") || className.equals("org.apache.spark.deploy.mesos.MesosExternalShuffleService")) { javaOptsKeys.add("SPARK_DAEMON_JAVA_OPTS"); javaOptsKeys.add("SPARK_SHUFFLE_OPTS"); memKey = "SPARK_DAEMON_MEMORY"; } else if (className.startsWith("org.apache.spark.tools.")) { String sparkHome = getSparkHome(); File toolsDir = new File(join(File.separator, sparkHome, "tools", "target", "scala-" + getScalaVersion())); checkState(toolsDir.isDirectory(), "Cannot find tools build directory."); Pattern re = Pattern.compile("spark-tools_.*\\.jar"); for (File f : toolsDir.listFiles()) { if (re.matcher(f.getName()).matches()) { extraClassPath = f.getAbsolutePath(); break; } } checkState(extraClassPath != null, "Failed to find Spark Tools Jar in %s.\n" + "You need to run \"build/sbt tools/package\" before running %s.", toolsDir.getAbsolutePath(), className); javaOptsKeys.add("SPARK_JAVA_OPTS"); } else { javaOptsKeys.add("SPARK_JAVA_OPTS"); memKey = "SPARK_DRIVER_MEMORY"; }
看46.47的代码,1.5可以通过SPARk_JAVA_OPTS和SPARK_DRIVER_MEMORY来设置beeline的内存