Linux下用Intel编译器编译安装NetCDF-Fortan库(4.2以后版本)
本来这个问题真的没必要写的,可是真的困扰我太久%>_<%,决定还是记录一下。
首先,最权威清晰的安装文档还是官方的:
Building the NetCDF-4.2 and later Fortran libraries (写此文时,最近版为4.2)
那这个文档最开始就告诉我们,自NetCDF库4.2版本以后,Fortran的库和C的库就要分开build啦!而且要装Fortran的库必须先装好C的库。
所以先装C的库咯:仍然官方文档:
Getting and Building NetCDF-C (写此文时,最新版本为4.3.2)
那这个文档告诉我们:要装NetCDF-C的库,有三个(其实是两个)必须装的:zlib,HDF5,(curl)。
综上,需要下载4个tar的包。点我们下载:zilb & hdf5 netcdf-c-4.3.2 netcdf-fortran-4.2
参照官方文档,zlib和hdf5的安装比较简单,指定一下安装路径即可:
build zlib:
$ ./configure --prefix=${DIR1}
$ make check install
build HDF5:
$ ./configure --with-zlib=${DIR1} --prefix=${DIR1}
$ make
$ make check
$ make install
其中,比较容易出问题的是HDF5的安装,参阅HDF5官方文档
成功之后,就可以进行netcdf-c和netcdf-fortran库的安装了,这里有个问题要注意:编译安装库时候的编译器要和你以后编译你的Fortran代码使用的编译器一致,否者以后在编译Fortran源代码其中用到netcdf库时会出错。以我为例:我平时用Intel的编译器,所以此时在安装这两个库的时候,分别用Intel C++ Composer和Intel Fortran Composer进行编译(后面简称icc和ifort)
User and Reference Guide for the Intel® C++ Compiler 14.0
User and Reference Guide for the Intel® Fortran Compiler 14.0
Using Intel Compilers for Linux Under Redhat Enterprise Linux or CentOS
安装好了icc和ifort以后均需要设置一下环境变量:(最好添加到~/.bashrc文件中)
source <compiler_install_dir>/bin/compilervars.sh intel64
接下来就是用Intel编译器编译安装netcdf库了:
Building NetCDF* with the Intel® compilers官方文档
关键就是设置几个编译选项:
export CC=icc export CXX=icpc export CFLAGS='-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel' export CXXFLAGS='-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel' export F77=ifort export FC=ifort export F90=ifort export FFLAGS='-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel' export CPP='icc -E' export CXXCPP='icpc -E'
对于c库:
export DIR1=/snfs01/ff/netcdf_4.3.2
$ CPPFLAGS=-I${DIR1}/include LDFLAGS=-L${DIR1}/lib ./configure --prefix=${DIR1} --disable-dap-remote-tests
$ make check install
对于Fortran库:
首先仍然如上设置编译选项,然后假设你的c库安装在路径${DIR1}:
export LD_LIBRARY_PATH=${DIR1}/lib:${LD_LIBRARY_PATH}
然后和c库的编译过程一样:
CPPFLAGS=-I${DIR1}/include LDFLAGS=-L${DIR1}/lib ./configure --prefix=${DIR1} make make check make install
装好了NetCDF-Fortran库了以后如何使用?参考文档: