摘要：
字符串连接函数paste 1、字符串连接：paste(..., sep = " ", collapse = NULL)sep表示分隔符，默认为空格。collapse表示如果不指定值，那么函数paste的返回值是自变量之间通过sep指定的分隔符连接后得到的一个字符型向量；如果为其指定了特定的值，那么自 阅读全文
摘要：
绘制Alpha多样性线箱图 绘图和统计全部为R语言，建议复制代码，在Rstuido中运行，并设置工作目录为存储之前分析结果文件的result目录 # 运行前，请在Rstudio中菜单栏选择“Session - Set work directory -- Choose directory”，弹窗选择之 阅读全文
摘要：
分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾：我们的OTU获得了物种注释，并学习OTU表的各种操作————添加信息，格式转换，筛选信息。 接下来我们学习对OTU序列的进化分析、同时计算Alpha和Beta多样性值。 16. 进化树构建 进化树是基于多序列比对的结果，可展 阅读全文
摘要：
本节课程，需要先完成《扩增子分析解读》系列之前的操作 1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类 4去嵌合体 非细菌序列 生成代表性序列和OTU表 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾：我们学习了 阅读全文