摘要：
本节课程，需要完成扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并和2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 先看一下扩增子分析的整体流程，从下向上逐层分析 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾：我们提取barcode，质控及样品拆分，切除扩增引物，经历了 阅读全文
摘要：
本节课程，需要完成扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 先看一下扩增子分析的整体流程，从下向上逐层分析 分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾：我们拿到了双端数据，进行了质控、并对实验设计进行了填写和检查、最后将双端数据合并为单个文件进行下游分析。 接下来 阅读全文
摘要：
通过 conda 安装 qiime 1后，在执行join_paired_ends.py时报错： burrito.util.ApplicationNotFoundError: Cannot find fastq-join. Is it installed? Is it in your path? 这是 阅读全文
摘要：
本文采用目前最主流的扩增子测序数据类型HiSeq2500 PE250类型数据为例，结合目前主流方法QIIME+USearch定制的分析流程。本课程中所需的测序数据、实验设计和课程分析生成的中间文件，均可以直去百度云下载。链接：http://pan.baidu.com/s/1hs1PXcw 密码：y3 阅读全文