摘要：
MySQL mac的安装着实费了些功夫。最开始想省事用brew 安装，结果总是有问题，原来brew安装MySQL并没那么简单，还要进行一些配置。索性直接到网站下载： http://www.mysql.com/downloads/ 选择 选择community server, 然后下载了dmg文件 其 阅读全文
2016年5月12日
2016年4月21日
摘要：
今天在HPCC上面想要删除一个文件夹，结果说“Device or resource busy". 于是google一下，发现这个是因为有程序正在运行，所以无法删除。 那么怎样解决？ lsof 命令可以找到你的正在运行的程序以及运行的地点，此外 lsof 还提供该程序的 pid。 因此只要 kill 阅读全文
2015年8月15日
摘要：
R的速度慢一直被人诟病，最近做一个比较大的dataset的分析，跑得实在太慢，发现症结是R的data frame的index太慢：以下为测试：gene_list = 1:100000eQTL_mat = matrix(nrow = length(gene_list), ncol = 7) # 创建一... 阅读全文
2015年7月24日
摘要：
使用R读取数据的时候遇到这种错误：invalid multibyte string at ''解决方法就是：tbl <- read.delim("dir/file.txt", fileEncoding="UCS-2LE")Refhttp://stackoverflow.com/questions/4... 阅读全文
2015年6月5日
摘要：
read.csv(text="A,B,T,T", header=FALSE)## V1 V2 V3 V4## 1 A B TRUE TRUERT, 有的时候R读取数据的时候容易遇到这种问题。怎样解决呢？调整几个参数即可：read.csv(text="A,B,T,T", header... 阅读全文
2015年5月5日
摘要：
In ENCODE project, we could see some files are called "...rxlch...", which means "reverse crosslinked Chromatin".What does this mean?According to the ... 阅读全文
2015年4月20日
摘要：
大一时候学过C++，可惜忘得差不多了，之后也很少用过。当时使用的是windows系统，使用的还是visual C++。当时对计算机并不感冒，也没好好学。最近在R的学习中遇到瓶颈，觉得要捡起曾经的C/C++。现在早已时过境迁，系统换成mac，以前的知识也早已忘得一干二净，只能重头再来。1. IDE选择... 阅读全文
2015年4月18日
摘要：
knitr包只能够将R markdown文件转为html格式，若想要将其转化为pdf格式，还要安装另一个包# Install and load packageinstall.packages("rmarkdown")library("rmarkdown")# Convertrender("../Yo... 阅读全文
2015年3月12日
摘要：
使用MACS1.4 进行peak calling的时候发现一个比较奇怪的问题：我的某些文件无法被MACS1.4 进行peak calling，出现如下的信息：Traceback (most recent call last): File "/usr/local/bin/macs14", line ... 阅读全文
2015年2月26日
